Protein–RNA interactions for Protein: Q810I2

Trim50, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM50, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim50Q810I2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim50Q810I2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim50Q810I2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim50Q810I2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim50Q810I2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim50Q810I2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trim50Q810I2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim50Q810I2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim50Q810I2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim50Q810I2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim50Q810I2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim50Q810I2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim50Q810I2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim50Q810I2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim50Q810I2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim50Q810I2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim50Q810I2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim50Q810I2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim50Q810I2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim50Q810I2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim50Q810I2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim50Q810I2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim50Q810I2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim50Q810I2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim50Q810I2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim50Q810I2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim50Q810I2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim50Q810I2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim50Q810I2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim50Q810I2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim50Q810I2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim50Q810I2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim50Q810I2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim50Q810I2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim50Q810I2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim50Q810I2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim50Q810I2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim50Q810I2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim50Q810I2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim50Q810I2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim50Q810I2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim50Q810I2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim50Q810I2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim50Q810I2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim50Q810I2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim50Q810I2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim50Q810I2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim50Q810I2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim50Q810I2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim50Q810I2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim50Q810I2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim50Q810I2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim50Q810I2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim50Q810I2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim50Q810I2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim50Q810I2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim50Q810I2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim50Q810I2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim50Q810I2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim50Q810I2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim50Q810I2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim50Q810I2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim50Q810I2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim50Q810I2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim50Q810I2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim50Q810I2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim50Q810I2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim50Q810I2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim50Q810I2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim50Q810I2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim50Q810I2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim50Q810I2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim50Q810I2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim50Q810I2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim50Q810I2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim50Q810I2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim50Q810I2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim50Q810I2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim50Q810I2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim50Q810I2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim50Q810I2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trim50Q810I2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trim50Q810I2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim50Q810I2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim50Q810I2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim50Q810I2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim50Q810I2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim50Q810I2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim50Q810I2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim50Q810I2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim50Q810I2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim50Q810I2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim50Q810I2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim50Q810I2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim50Q810I2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim50Q810I2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim50Q810I2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim50Q810I2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim50Q810I2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim50Q810I2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms