Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZS5

Cldn34b3, Claudin 34B3, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b3Q80ZS5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cldn34b3Q80ZS5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cldn34b3Q80ZS5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cldn34b3Q80ZS5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cldn34b3Q80ZS5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cldn34b3Q80ZS5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cldn34b3Q80ZS5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cldn34b3Q80ZS5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cldn34b3Q80ZS5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cldn34b3Q80ZS5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cldn34b3Q80ZS5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cldn34b3Q80ZS5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cldn34b3Q80ZS5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cldn34b3Q80ZS5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cldn34b3Q80ZS5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cldn34b3Q80ZS5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cldn34b3Q80ZS5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cldn34b3Q80ZS5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Cldn34b3Q80ZS5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cldn34b3Q80ZS5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cldn34b3Q80ZS5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cldn34b3Q80ZS5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cldn34b3Q80ZS5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cldn34b3Q80ZS5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cldn34b3Q80ZS5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cldn34b3Q80ZS5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cldn34b3Q80ZS5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cldn34b3Q80ZS5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cldn34b3Q80ZS5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cldn34b3Q80ZS5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cldn34b3Q80ZS5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cldn34b3Q80ZS5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cldn34b3Q80ZS5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cldn34b3Q80ZS5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cldn34b3Q80ZS5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cldn34b3Q80ZS5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cldn34b3Q80ZS5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cldn34b3Q80ZS5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cldn34b3Q80ZS5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cldn34b3Q80ZS5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cldn34b3Q80ZS5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Cldn34b3Q80ZS5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cldn34b3Q80ZS5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cldn34b3Q80ZS5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cldn34b3Q80ZS5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cldn34b3Q80ZS5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cldn34b3Q80ZS5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cldn34b3Q80ZS5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cldn34b3Q80ZS5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cldn34b3Q80ZS5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cldn34b3Q80ZS5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cldn34b3Q80ZS5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Cldn34b3Q80ZS5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Cldn34b3Q80ZS5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cldn34b3Q80ZS5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Cldn34b3Q80ZS5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cldn34b3Q80ZS5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cldn34b3Q80ZS5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cldn34b3Q80ZS5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cldn34b3Q80ZS5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cldn34b3Q80ZS5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Cldn34b3Q80ZS5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cldn34b3Q80ZS5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cldn34b3Q80ZS5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cldn34b3Q80ZS5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cldn34b3Q80ZS5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cldn34b3Q80ZS5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cldn34b3Q80ZS5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cldn34b3Q80ZS5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cldn34b3Q80ZS5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cldn34b3Q80ZS5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cldn34b3Q80ZS5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cldn34b3Q80ZS5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cldn34b3Q80ZS5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cldn34b3Q80ZS5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Cldn34b3Q80ZS5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cldn34b3Q80ZS5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cldn34b3Q80ZS5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cldn34b3Q80ZS5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cldn34b3Q80ZS5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cldn34b3Q80ZS5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cldn34b3Q80ZS5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cldn34b3Q80ZS5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cldn34b3Q80ZS5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cldn34b3Q80ZS5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cldn34b3Q80ZS5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cldn34b3Q80ZS5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cldn34b3Q80ZS5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cldn34b3Q80ZS5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cldn34b3Q80ZS5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cldn34b3Q80ZS5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cldn34b3Q80ZS5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cldn34b3Q80ZS5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cldn34b3Q80ZS5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cldn34b3Q80ZS5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cldn34b3Q80ZS5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cldn34b3Q80ZS5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cldn34b3Q80ZS5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cldn34b3Q80ZS5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cldn34b3Q80ZS5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms