Protein–RNA interactions for Protein: Q80XH2

Impg2, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Impg2Q80XH2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Impg2Q80XH2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Impg2Q80XH2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Impg2Q80XH2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Impg2Q80XH2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Impg2Q80XH2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Impg2Q80XH2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Impg2Q80XH2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Impg2Q80XH2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Impg2Q80XH2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Impg2Q80XH2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Impg2Q80XH2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Impg2Q80XH2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Impg2Q80XH2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Impg2Q80XH2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Impg2Q80XH2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Impg2Q80XH2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Impg2Q80XH2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Impg2Q80XH2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Impg2Q80XH2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Impg2Q80XH2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Impg2Q80XH2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Impg2Q80XH2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Impg2Q80XH2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Impg2Q80XH2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Impg2Q80XH2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Impg2Q80XH2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Impg2Q80XH2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Impg2Q80XH2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Impg2Q80XH2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Impg2Q80XH2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Impg2Q80XH2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Impg2Q80XH2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Impg2Q80XH2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Impg2Q80XH2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Impg2Q80XH2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Impg2Q80XH2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Impg2Q80XH2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Impg2Q80XH2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Impg2Q80XH2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Impg2Q80XH2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Impg2Q80XH2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Impg2Q80XH2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Impg2Q80XH2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Impg2Q80XH2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Impg2Q80XH2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Impg2Q80XH2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Impg2Q80XH2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Impg2Q80XH2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Impg2Q80XH2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Impg2Q80XH2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Impg2Q80XH2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Impg2Q80XH2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Impg2Q80XH2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Impg2Q80XH2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Impg2Q80XH2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Impg2Q80XH2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Impg2Q80XH2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Impg2Q80XH2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Impg2Q80XH2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Impg2Q80XH2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Impg2Q80XH2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Impg2Q80XH2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Impg2Q80XH2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Impg2Q80XH2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Impg2Q80XH2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Impg2Q80XH2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Impg2Q80XH2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Impg2Q80XH2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Impg2Q80XH2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Impg2Q80XH2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Impg2Q80XH2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Impg2Q80XH2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Impg2Q80XH2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Impg2Q80XH2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Impg2Q80XH2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Impg2Q80XH2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Impg2Q80XH2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Impg2Q80XH2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Impg2Q80XH2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Impg2Q80XH2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Impg2Q80XH2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Impg2Q80XH2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Impg2Q80XH2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Impg2Q80XH2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Impg2Q80XH2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Impg2Q80XH2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Impg2Q80XH2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Impg2Q80XH2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Impg2Q80XH2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Impg2Q80XH2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Impg2Q80XH2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Impg2Q80XH2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Impg2Q80XH2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Impg2Q80XH2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Impg2Q80XH2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Impg2Q80XH2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Impg2Q80XH2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Impg2Q80XH2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Impg2Q80XH2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms