Protein–RNA interactions for Protein: Q80WK2

Slc51b, Organic solute transporter subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc51bQ80WK2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc51bQ80WK2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc51bQ80WK2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc51bQ80WK2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc51bQ80WK2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc51bQ80WK2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc51bQ80WK2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc51bQ80WK2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc51bQ80WK2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc51bQ80WK2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc51bQ80WK2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc51bQ80WK2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc51bQ80WK2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc51bQ80WK2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc51bQ80WK2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc51bQ80WK2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc51bQ80WK2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc51bQ80WK2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc51bQ80WK2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc51bQ80WK2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc51bQ80WK2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc51bQ80WK2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc51bQ80WK2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Slc51bQ80WK2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc51bQ80WK2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc51bQ80WK2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc51bQ80WK2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc51bQ80WK2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc51bQ80WK2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc51bQ80WK2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc51bQ80WK2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc51bQ80WK2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc51bQ80WK2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc51bQ80WK2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc51bQ80WK2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc51bQ80WK2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc51bQ80WK2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc51bQ80WK2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc51bQ80WK2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc51bQ80WK2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc51bQ80WK2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc51bQ80WK2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc51bQ80WK2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc51bQ80WK2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc51bQ80WK2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Slc51bQ80WK2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slc51bQ80WK2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slc51bQ80WK2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slc51bQ80WK2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc51bQ80WK2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc51bQ80WK2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc51bQ80WK2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc51bQ80WK2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc51bQ80WK2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc51bQ80WK2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc51bQ80WK2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc51bQ80WK2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc51bQ80WK2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc51bQ80WK2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc51bQ80WK2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc51bQ80WK2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc51bQ80WK2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc51bQ80WK2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc51bQ80WK2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc51bQ80WK2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc51bQ80WK2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc51bQ80WK2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc51bQ80WK2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc51bQ80WK2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc51bQ80WK2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc51bQ80WK2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc51bQ80WK2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc51bQ80WK2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc51bQ80WK2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc51bQ80WK2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc51bQ80WK2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc51bQ80WK2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc51bQ80WK2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc51bQ80WK2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc51bQ80WK2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc51bQ80WK2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc51bQ80WK2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc51bQ80WK2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc51bQ80WK2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc51bQ80WK2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc51bQ80WK2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc51bQ80WK2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc51bQ80WK2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc51bQ80WK2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc51bQ80WK2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc51bQ80WK2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc51bQ80WK2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc51bQ80WK2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc51bQ80WK2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc51bQ80WK2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc51bQ80WK2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc51bQ80WK2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc51bQ80WK2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc51bQ80WK2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc51bQ80WK2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms