Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ0

Aldh3b1, Aldehyde dehydrogenase family 3 member B1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh3b1Q80VQ0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Aldh3b1Q80VQ0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Aldh3b1Q80VQ0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Aldh3b1Q80VQ0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Aldh3b1Q80VQ0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Aldh3b1Q80VQ0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Aldh3b1Q80VQ0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Aldh3b1Q80VQ0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Aldh3b1Q80VQ0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Aldh3b1Q80VQ0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Aldh3b1Q80VQ0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Aldh3b1Q80VQ0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Aldh3b1Q80VQ0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Aldh3b1Q80VQ0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Aldh3b1Q80VQ0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Aldh3b1Q80VQ0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Aldh3b1Q80VQ0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Aldh3b1Q80VQ0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Aldh3b1Q80VQ0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Aldh3b1Q80VQ0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Aldh3b1Q80VQ0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Aldh3b1Q80VQ0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Aldh3b1Q80VQ0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Aldh3b1Q80VQ0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Aldh3b1Q80VQ0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Aldh3b1Q80VQ0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Aldh3b1Q80VQ0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Aldh3b1Q80VQ0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Aldh3b1Q80VQ0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Aldh3b1Q80VQ0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Aldh3b1Q80VQ0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Aldh3b1Q80VQ0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Aldh3b1Q80VQ0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Aldh3b1Q80VQ0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Aldh3b1Q80VQ0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Aldh3b1Q80VQ0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Aldh3b1Q80VQ0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Aldh3b1Q80VQ0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Aldh3b1Q80VQ0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Aldh3b1Q80VQ0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Aldh3b1Q80VQ0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Aldh3b1Q80VQ0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Aldh3b1Q80VQ0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Aldh3b1Q80VQ0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Aldh3b1Q80VQ0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Aldh3b1Q80VQ0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Aldh3b1Q80VQ0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Aldh3b1Q80VQ0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Aldh3b1Q80VQ0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Aldh3b1Q80VQ0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Aldh3b1Q80VQ0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Aldh3b1Q80VQ0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Aldh3b1Q80VQ0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Aldh3b1Q80VQ0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Aldh3b1Q80VQ0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Aldh3b1Q80VQ0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Aldh3b1Q80VQ0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Aldh3b1Q80VQ0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Aldh3b1Q80VQ0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Aldh3b1Q80VQ0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Aldh3b1Q80VQ0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Aldh3b1Q80VQ0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Aldh3b1Q80VQ0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Aldh3b1Q80VQ0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Aldh3b1Q80VQ0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Aldh3b1Q80VQ0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Aldh3b1Q80VQ0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Aldh3b1Q80VQ0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Aldh3b1Q80VQ0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Aldh3b1Q80VQ0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Aldh3b1Q80VQ0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Aldh3b1Q80VQ0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Aldh3b1Q80VQ0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Aldh3b1Q80VQ0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Aldh3b1Q80VQ0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Aldh3b1Q80VQ0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Aldh3b1Q80VQ0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Aldh3b1Q80VQ0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Aldh3b1Q80VQ0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Aldh3b1Q80VQ0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Aldh3b1Q80VQ0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Aldh3b1Q80VQ0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Aldh3b1Q80VQ0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Aldh3b1Q80VQ0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Aldh3b1Q80VQ0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Aldh3b1Q80VQ0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Aldh3b1Q80VQ0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Aldh3b1Q80VQ0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Aldh3b1Q80VQ0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Aldh3b1Q80VQ0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Aldh3b1Q80VQ0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Aldh3b1Q80VQ0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Aldh3b1Q80VQ0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Aldh3b1Q80VQ0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Aldh3b1Q80VQ0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Aldh3b1Q80VQ0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Aldh3b1Q80VQ0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Aldh3b1Q80VQ0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Aldh3b1Q80VQ0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Aldh3b1Q80VQ0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 140.8 ms