Protein–RNA interactions for Protein: Q80UK0

Sestd1, SEC14 domain and spectrin repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sestd1Q80UK0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sestd1Q80UK0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sestd1Q80UK0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sestd1Q80UK0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sestd1Q80UK0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sestd1Q80UK0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sestd1Q80UK0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sestd1Q80UK0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sestd1Q80UK0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sestd1Q80UK0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sestd1Q80UK0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sestd1Q80UK0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sestd1Q80UK0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sestd1Q80UK0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sestd1Q80UK0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sestd1Q80UK0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sestd1Q80UK0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sestd1Q80UK0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sestd1Q80UK0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Sestd1Q80UK0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sestd1Q80UK0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sestd1Q80UK0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sestd1Q80UK0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sestd1Q80UK0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sestd1Q80UK0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sestd1Q80UK0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sestd1Q80UK0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sestd1Q80UK0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sestd1Q80UK0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sestd1Q80UK0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sestd1Q80UK0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sestd1Q80UK0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sestd1Q80UK0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sestd1Q80UK0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sestd1Q80UK0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sestd1Q80UK0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sestd1Q80UK0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sestd1Q80UK0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sestd1Q80UK0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sestd1Q80UK0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sestd1Q80UK0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sestd1Q80UK0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sestd1Q80UK0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sestd1Q80UK0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sestd1Q80UK0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sestd1Q80UK0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sestd1Q80UK0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sestd1Q80UK0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sestd1Q80UK0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sestd1Q80UK0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sestd1Q80UK0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sestd1Q80UK0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sestd1Q80UK0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sestd1Q80UK0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sestd1Q80UK0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Sestd1Q80UK0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Sestd1Q80UK0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sestd1Q80UK0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sestd1Q80UK0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sestd1Q80UK0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sestd1Q80UK0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sestd1Q80UK0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Sestd1Q80UK0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sestd1Q80UK0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sestd1Q80UK0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sestd1Q80UK0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sestd1Q80UK0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sestd1Q80UK0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sestd1Q80UK0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sestd1Q80UK0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sestd1Q80UK0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sestd1Q80UK0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sestd1Q80UK0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sestd1Q80UK0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sestd1Q80UK0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sestd1Q80UK0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sestd1Q80UK0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Sestd1Q80UK0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Sestd1Q80UK0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sestd1Q80UK0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Sestd1Q80UK0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sestd1Q80UK0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sestd1Q80UK0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sestd1Q80UK0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sestd1Q80UK0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sestd1Q80UK0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sestd1Q80UK0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sestd1Q80UK0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sestd1Q80UK0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sestd1Q80UK0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sestd1Q80UK0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sestd1Q80UK0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sestd1Q80UK0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sestd1Q80UK0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sestd1Q80UK0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sestd1Q80UK0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Sestd1Q80UK0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sestd1Q80UK0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sestd1Q80UK0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sestd1Q80UK0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107 ms