Protein–RNA interactions for Protein: Q80UJ7

Rab3gap1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3gap1Q80UJ7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rab3gap1Q80UJ7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rab3gap1Q80UJ7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rab3gap1Q80UJ7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Rab3gap1Q80UJ7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Rab3gap1Q80UJ7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rab3gap1Q80UJ7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rab3gap1Q80UJ7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rab3gap1Q80UJ7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rab3gap1Q80UJ7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rab3gap1Q80UJ7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rab3gap1Q80UJ7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Rab3gap1Q80UJ7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Rab3gap1Q80UJ7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rab3gap1Q80UJ7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rab3gap1Q80UJ7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rab3gap1Q80UJ7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rab3gap1Q80UJ7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rab3gap1Q80UJ7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rab3gap1Q80UJ7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rab3gap1Q80UJ7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rab3gap1Q80UJ7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rab3gap1Q80UJ7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rab3gap1Q80UJ7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Rab3gap1Q80UJ7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Rab3gap1Q80UJ7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Rab3gap1Q80UJ7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rab3gap1Q80UJ7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rab3gap1Q80UJ7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rab3gap1Q80UJ7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rab3gap1Q80UJ7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rab3gap1Q80UJ7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rab3gap1Q80UJ7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Rab3gap1Q80UJ7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rab3gap1Q80UJ7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rab3gap1Q80UJ7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rab3gap1Q80UJ7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rab3gap1Q80UJ7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rab3gap1Q80UJ7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rab3gap1Q80UJ7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rab3gap1Q80UJ7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rab3gap1Q80UJ7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rab3gap1Q80UJ7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rab3gap1Q80UJ7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rab3gap1Q80UJ7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rab3gap1Q80UJ7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rab3gap1Q80UJ7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rab3gap1Q80UJ7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rab3gap1Q80UJ7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rab3gap1Q80UJ7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rab3gap1Q80UJ7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rab3gap1Q80UJ7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rab3gap1Q80UJ7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rab3gap1Q80UJ7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rab3gap1Q80UJ7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rab3gap1Q80UJ7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rab3gap1Q80UJ7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rab3gap1Q80UJ7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rab3gap1Q80UJ7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rab3gap1Q80UJ7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Rab3gap1Q80UJ7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rab3gap1Q80UJ7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rab3gap1Q80UJ7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rab3gap1Q80UJ7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rab3gap1Q80UJ7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rab3gap1Q80UJ7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rab3gap1Q80UJ7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rab3gap1Q80UJ7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rab3gap1Q80UJ7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rab3gap1Q80UJ7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rab3gap1Q80UJ7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rab3gap1Q80UJ7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rab3gap1Q80UJ7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rab3gap1Q80UJ7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Rab3gap1Q80UJ7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rab3gap1Q80UJ7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rab3gap1Q80UJ7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rab3gap1Q80UJ7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rab3gap1Q80UJ7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rab3gap1Q80UJ7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rab3gap1Q80UJ7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Rab3gap1Q80UJ7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Rab3gap1Q80UJ7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Rab3gap1Q80UJ7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Rab3gap1Q80UJ7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rab3gap1Q80UJ7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rab3gap1Q80UJ7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rab3gap1Q80UJ7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rab3gap1Q80UJ7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rab3gap1Q80UJ7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rab3gap1Q80UJ7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rab3gap1Q80UJ7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rab3gap1Q80UJ7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rab3gap1Q80UJ7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rab3gap1Q80UJ7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rab3gap1Q80UJ7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rab3gap1Q80UJ7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rab3gap1Q80UJ7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Rab3gap1Q80UJ7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rab3gap1Q80UJ7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms