Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ95

Lnpk, Endoplasmic reticulum junction formation protein lunapark, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LnpkQ7TQ95 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LnpkQ7TQ95 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LnpkQ7TQ95 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LnpkQ7TQ95 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LnpkQ7TQ95 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LnpkQ7TQ95 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LnpkQ7TQ95 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LnpkQ7TQ95 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LnpkQ7TQ95 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LnpkQ7TQ95 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LnpkQ7TQ95 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LnpkQ7TQ95 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LnpkQ7TQ95 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LnpkQ7TQ95 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LnpkQ7TQ95 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LnpkQ7TQ95 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LnpkQ7TQ95 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LnpkQ7TQ95 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LnpkQ7TQ95 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LnpkQ7TQ95 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LnpkQ7TQ95 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LnpkQ7TQ95 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LnpkQ7TQ95 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LnpkQ7TQ95 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LnpkQ7TQ95 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LnpkQ7TQ95 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LnpkQ7TQ95 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LnpkQ7TQ95 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LnpkQ7TQ95 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LnpkQ7TQ95 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LnpkQ7TQ95 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LnpkQ7TQ95 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LnpkQ7TQ95 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LnpkQ7TQ95 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LnpkQ7TQ95 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LnpkQ7TQ95 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LnpkQ7TQ95 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LnpkQ7TQ95 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LnpkQ7TQ95 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LnpkQ7TQ95 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LnpkQ7TQ95 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LnpkQ7TQ95 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LnpkQ7TQ95 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LnpkQ7TQ95 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LnpkQ7TQ95 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LnpkQ7TQ95 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LnpkQ7TQ95 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LnpkQ7TQ95 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LnpkQ7TQ95 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LnpkQ7TQ95 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LnpkQ7TQ95 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LnpkQ7TQ95 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LnpkQ7TQ95 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LnpkQ7TQ95 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LnpkQ7TQ95 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LnpkQ7TQ95 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LnpkQ7TQ95 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LnpkQ7TQ95 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LnpkQ7TQ95 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LnpkQ7TQ95 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LnpkQ7TQ95 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LnpkQ7TQ95 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LnpkQ7TQ95 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LnpkQ7TQ95 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LnpkQ7TQ95 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LnpkQ7TQ95 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LnpkQ7TQ95 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LnpkQ7TQ95 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LnpkQ7TQ95 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LnpkQ7TQ95 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LnpkQ7TQ95 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LnpkQ7TQ95 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LnpkQ7TQ95 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LnpkQ7TQ95 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LnpkQ7TQ95 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
LnpkQ7TQ95 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LnpkQ7TQ95 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LnpkQ7TQ95 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LnpkQ7TQ95 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LnpkQ7TQ95 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LnpkQ7TQ95 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LnpkQ7TQ95 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LnpkQ7TQ95 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LnpkQ7TQ95 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LnpkQ7TQ95 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LnpkQ7TQ95 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LnpkQ7TQ95 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LnpkQ7TQ95 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LnpkQ7TQ95 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LnpkQ7TQ95 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LnpkQ7TQ95 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LnpkQ7TQ95 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LnpkQ7TQ95 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LnpkQ7TQ95 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LnpkQ7TQ95 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LnpkQ7TQ95 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LnpkQ7TQ95 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LnpkQ7TQ95 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LnpkQ7TQ95 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LnpkQ7TQ95 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms