Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNM2

Trim46, Tripartite motif-containing protein 46, mousemouse

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim46Q7TNM2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim46Q7TNM2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim46Q7TNM2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim46Q7TNM2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim46Q7TNM2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim46Q7TNM2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim46Q7TNM2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim46Q7TNM2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim46Q7TNM2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim46Q7TNM2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim46Q7TNM2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim46Q7TNM2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim46Q7TNM2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim46Q7TNM2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim46Q7TNM2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim46Q7TNM2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim46Q7TNM2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim46Q7TNM2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim46Q7TNM2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim46Q7TNM2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim46Q7TNM2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim46Q7TNM2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim46Q7TNM2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim46Q7TNM2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim46Q7TNM2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim46Q7TNM2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim46Q7TNM2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim46Q7TNM2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim46Q7TNM2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim46Q7TNM2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim46Q7TNM2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim46Q7TNM2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim46Q7TNM2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim46Q7TNM2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim46Q7TNM2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim46Q7TNM2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim46Q7TNM2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim46Q7TNM2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim46Q7TNM2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim46Q7TNM2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim46Q7TNM2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim46Q7TNM2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim46Q7TNM2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim46Q7TNM2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim46Q7TNM2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim46Q7TNM2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim46Q7TNM2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim46Q7TNM2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim46Q7TNM2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim46Q7TNM2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim46Q7TNM2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim46Q7TNM2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim46Q7TNM2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim46Q7TNM2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim46Q7TNM2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Trim46Q7TNM2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim46Q7TNM2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim46Q7TNM2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim46Q7TNM2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim46Q7TNM2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim46Q7TNM2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim46Q7TNM2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim46Q7TNM2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim46Q7TNM2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim46Q7TNM2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Trim46Q7TNM2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Trim46Q7TNM2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim46Q7TNM2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim46Q7TNM2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim46Q7TNM2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim46Q7TNM2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim46Q7TNM2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim46Q7TNM2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim46Q7TNM2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim46Q7TNM2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim46Q7TNM2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim46Q7TNM2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim46Q7TNM2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim46Q7TNM2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim46Q7TNM2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim46Q7TNM2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim46Q7TNM2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim46Q7TNM2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim46Q7TNM2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim46Q7TNM2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trim46Q7TNM2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim46Q7TNM2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim46Q7TNM2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim46Q7TNM2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim46Q7TNM2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim46Q7TNM2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim46Q7TNM2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim46Q7TNM2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim46Q7TNM2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim46Q7TNM2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim46Q7TNM2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim46Q7TNM2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim46Q7TNM2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim46Q7TNM2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim46Q7TNM2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 195.2 ms