Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK1

Rfx4, Transcription factor RFX4, mousemouse

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx4Q7TNK1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rfx4Q7TNK1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rfx4Q7TNK1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rfx4Q7TNK1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rfx4Q7TNK1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rfx4Q7TNK1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rfx4Q7TNK1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rfx4Q7TNK1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rfx4Q7TNK1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rfx4Q7TNK1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rfx4Q7TNK1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rfx4Q7TNK1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rfx4Q7TNK1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rfx4Q7TNK1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rfx4Q7TNK1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rfx4Q7TNK1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rfx4Q7TNK1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rfx4Q7TNK1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rfx4Q7TNK1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rfx4Q7TNK1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rfx4Q7TNK1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rfx4Q7TNK1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rfx4Q7TNK1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rfx4Q7TNK1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rfx4Q7TNK1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rfx4Q7TNK1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rfx4Q7TNK1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rfx4Q7TNK1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rfx4Q7TNK1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rfx4Q7TNK1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rfx4Q7TNK1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rfx4Q7TNK1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rfx4Q7TNK1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rfx4Q7TNK1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rfx4Q7TNK1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rfx4Q7TNK1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rfx4Q7TNK1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rfx4Q7TNK1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rfx4Q7TNK1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rfx4Q7TNK1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rfx4Q7TNK1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rfx4Q7TNK1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rfx4Q7TNK1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rfx4Q7TNK1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rfx4Q7TNK1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rfx4Q7TNK1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rfx4Q7TNK1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rfx4Q7TNK1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rfx4Q7TNK1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rfx4Q7TNK1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rfx4Q7TNK1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rfx4Q7TNK1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rfx4Q7TNK1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rfx4Q7TNK1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rfx4Q7TNK1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rfx4Q7TNK1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rfx4Q7TNK1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rfx4Q7TNK1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rfx4Q7TNK1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rfx4Q7TNK1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rfx4Q7TNK1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rfx4Q7TNK1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rfx4Q7TNK1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rfx4Q7TNK1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rfx4Q7TNK1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rfx4Q7TNK1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rfx4Q7TNK1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rfx4Q7TNK1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rfx4Q7TNK1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rfx4Q7TNK1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rfx4Q7TNK1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rfx4Q7TNK1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rfx4Q7TNK1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rfx4Q7TNK1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rfx4Q7TNK1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Rfx4Q7TNK1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rfx4Q7TNK1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rfx4Q7TNK1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rfx4Q7TNK1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rfx4Q7TNK1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rfx4Q7TNK1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rfx4Q7TNK1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rfx4Q7TNK1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rfx4Q7TNK1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rfx4Q7TNK1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rfx4Q7TNK1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rfx4Q7TNK1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rfx4Q7TNK1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rfx4Q7TNK1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rfx4Q7TNK1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rfx4Q7TNK1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Rfx4Q7TNK1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rfx4Q7TNK1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rfx4Q7TNK1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rfx4Q7TNK1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rfx4Q7TNK1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Rfx4Q7TNK1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rfx4Q7TNK1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rfx4Q7TNK1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rfx4Q7TNK1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms