Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Nphp3Q7TNH6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Nphp3Q7TNH6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Nphp3Q7TNH6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Nphp3Q7TNH6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Nphp3Q7TNH6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Nphp3Q7TNH6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Nphp3Q7TNH6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Nphp3Q7TNH6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Nphp3Q7TNH6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Nphp3Q7TNH6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Nphp3Q7TNH6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Nphp3Q7TNH6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Nphp3Q7TNH6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Nphp3Q7TNH6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Nphp3Q7TNH6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Nphp3Q7TNH6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Nphp3Q7TNH6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Nphp3Q7TNH6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Nphp3Q7TNH6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Nphp3Q7TNH6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Nphp3Q7TNH6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Nphp3Q7TNH6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Nphp3Q7TNH6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Nphp3Q7TNH6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Nphp3Q7TNH6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Nphp3Q7TNH6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Nphp3Q7TNH6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nphp3Q7TNH6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nphp3Q7TNH6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Nphp3Q7TNH6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Nphp3Q7TNH6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Nphp3Q7TNH6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Nphp3Q7TNH6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Nphp3Q7TNH6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Nphp3Q7TNH6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Nphp3Q7TNH6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Nphp3Q7TNH6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Nphp3Q7TNH6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Nphp3Q7TNH6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Nphp3Q7TNH6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Nphp3Q7TNH6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Nphp3Q7TNH6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Nphp3Q7TNH6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Nphp3Q7TNH6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Nphp3Q7TNH6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Nphp3Q7TNH6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Nphp3Q7TNH6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Nphp3Q7TNH6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Nphp3Q7TNH6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Nphp3Q7TNH6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Nphp3Q7TNH6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Nphp3Q7TNH6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Nphp3Q7TNH6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Nphp3Q7TNH6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Nphp3Q7TNH6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Nphp3Q7TNH6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Nphp3Q7TNH6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Nphp3Q7TNH6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Nphp3Q7TNH6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Nphp3Q7TNH6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Nphp3Q7TNH6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Nphp3Q7TNH6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Nphp3Q7TNH6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Nphp3Q7TNH6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Nphp3Q7TNH6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nphp3Q7TNH6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nphp3Q7TNH6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nphp3Q7TNH6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Nphp3Q7TNH6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Nphp3Q7TNH6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Nphp3Q7TNH6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Nphp3Q7TNH6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Nphp3Q7TNH6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Nphp3Q7TNH6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Nphp3Q7TNH6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Nphp3Q7TNH6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Nphp3Q7TNH6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Nphp3Q7TNH6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Nphp3Q7TNH6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Nphp3Q7TNH6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Nphp3Q7TNH6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Nphp3Q7TNH6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Nphp3Q7TNH6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Nphp3Q7TNH6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Nphp3Q7TNH6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Nphp3Q7TNH6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Nphp3Q7TNH6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Nphp3Q7TNH6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Nphp3Q7TNH6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Nphp3Q7TNH6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Nphp3Q7TNH6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Nphp3Q7TNH6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Nphp3Q7TNH6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Nphp3Q7TNH6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Nphp3Q7TNH6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Nphp3Q7TNH6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Nphp3Q7TNH6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Nphp3Q7TNH6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Nphp3Q7TNH6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms