Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN29

Smap2, Stromal membrane-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smap2Q7TN29 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smap2Q7TN29 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smap2Q7TN29 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smap2Q7TN29 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Smap2Q7TN29 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smap2Q7TN29 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smap2Q7TN29 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smap2Q7TN29 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smap2Q7TN29 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smap2Q7TN29 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smap2Q7TN29 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smap2Q7TN29 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smap2Q7TN29 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smap2Q7TN29 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smap2Q7TN29 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smap2Q7TN29 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smap2Q7TN29 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smap2Q7TN29 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smap2Q7TN29 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smap2Q7TN29 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smap2Q7TN29 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smap2Q7TN29 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Smap2Q7TN29 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Smap2Q7TN29 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smap2Q7TN29 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smap2Q7TN29 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smap2Q7TN29 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smap2Q7TN29 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smap2Q7TN29 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smap2Q7TN29 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smap2Q7TN29 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Smap2Q7TN29 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smap2Q7TN29 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smap2Q7TN29 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smap2Q7TN29 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smap2Q7TN29 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smap2Q7TN29 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smap2Q7TN29 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smap2Q7TN29 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Smap2Q7TN29 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smap2Q7TN29 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smap2Q7TN29 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Smap2Q7TN29 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smap2Q7TN29 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Smap2Q7TN29 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smap2Q7TN29 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smap2Q7TN29 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smap2Q7TN29 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smap2Q7TN29 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smap2Q7TN29 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smap2Q7TN29 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smap2Q7TN29 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smap2Q7TN29 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smap2Q7TN29 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Smap2Q7TN29 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smap2Q7TN29 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smap2Q7TN29 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Smap2Q7TN29 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smap2Q7TN29 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smap2Q7TN29 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smap2Q7TN29 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Smap2Q7TN29 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smap2Q7TN29 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smap2Q7TN29 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smap2Q7TN29 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smap2Q7TN29 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smap2Q7TN29 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smap2Q7TN29 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smap2Q7TN29 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smap2Q7TN29 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smap2Q7TN29 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smap2Q7TN29 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smap2Q7TN29 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smap2Q7TN29 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smap2Q7TN29 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smap2Q7TN29 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smap2Q7TN29 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smap2Q7TN29 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smap2Q7TN29 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smap2Q7TN29 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smap2Q7TN29 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Smap2Q7TN29 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Smap2Q7TN29 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Smap2Q7TN29 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smap2Q7TN29 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smap2Q7TN29 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smap2Q7TN29 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smap2Q7TN29 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smap2Q7TN29 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Smap2Q7TN29 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smap2Q7TN29 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smap2Q7TN29 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smap2Q7TN29 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smap2Q7TN29 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smap2Q7TN29 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smap2Q7TN29 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Smap2Q7TN29 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smap2Q7TN29 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smap2Q7TN29 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smap2Q7TN29 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms