Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMM9

Tubb2a, Tubulin beta-2A chain, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb2aQ7TMM9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tubb2aQ7TMM9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tubb2aQ7TMM9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tubb2aQ7TMM9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tubb2aQ7TMM9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tubb2aQ7TMM9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tubb2aQ7TMM9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tubb2aQ7TMM9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tubb2aQ7TMM9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tubb2aQ7TMM9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tubb2aQ7TMM9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tubb2aQ7TMM9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tubb2aQ7TMM9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tubb2aQ7TMM9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tubb2aQ7TMM9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tubb2aQ7TMM9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tubb2aQ7TMM9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Tubb2aQ7TMM9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tubb2aQ7TMM9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tubb2aQ7TMM9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tubb2aQ7TMM9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tubb2aQ7TMM9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tubb2aQ7TMM9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tubb2aQ7TMM9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Tubb2aQ7TMM9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Tubb2aQ7TMM9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tubb2aQ7TMM9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tubb2aQ7TMM9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tubb2aQ7TMM9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tubb2aQ7TMM9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tubb2aQ7TMM9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Tubb2aQ7TMM9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tubb2aQ7TMM9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tubb2aQ7TMM9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tubb2aQ7TMM9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tubb2aQ7TMM9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tubb2aQ7TMM9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tubb2aQ7TMM9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tubb2aQ7TMM9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tubb2aQ7TMM9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tubb2aQ7TMM9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tubb2aQ7TMM9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tubb2aQ7TMM9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tubb2aQ7TMM9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tubb2aQ7TMM9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tubb2aQ7TMM9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tubb2aQ7TMM9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tubb2aQ7TMM9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tubb2aQ7TMM9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Tubb2aQ7TMM9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tubb2aQ7TMM9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tubb2aQ7TMM9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tubb2aQ7TMM9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tubb2aQ7TMM9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tubb2aQ7TMM9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tubb2aQ7TMM9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tubb2aQ7TMM9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tubb2aQ7TMM9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tubb2aQ7TMM9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tubb2aQ7TMM9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tubb2aQ7TMM9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tubb2aQ7TMM9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tubb2aQ7TMM9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tubb2aQ7TMM9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tubb2aQ7TMM9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tubb2aQ7TMM9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tubb2aQ7TMM9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Tubb2aQ7TMM9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tubb2aQ7TMM9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tubb2aQ7TMM9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tubb2aQ7TMM9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tubb2aQ7TMM9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tubb2aQ7TMM9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tubb2aQ7TMM9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tubb2aQ7TMM9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tubb2aQ7TMM9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tubb2aQ7TMM9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tubb2aQ7TMM9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tubb2aQ7TMM9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tubb2aQ7TMM9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tubb2aQ7TMM9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tubb2aQ7TMM9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tubb2aQ7TMM9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tubb2aQ7TMM9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tubb2aQ7TMM9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tubb2aQ7TMM9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tubb2aQ7TMM9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tubb2aQ7TMM9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tubb2aQ7TMM9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tubb2aQ7TMM9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tubb2aQ7TMM9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Tubb2aQ7TMM9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tubb2aQ7TMM9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tubb2aQ7TMM9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tubb2aQ7TMM9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tubb2aQ7TMM9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tubb2aQ7TMM9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tubb2aQ7TMM9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tubb2aQ7TMM9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tubb2aQ7TMM9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.3 ms