Protein–RNA interactions for Protein: Q7M729

Scn4b, Sodium channel subunit beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4bQ7M729 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scn4bQ7M729 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scn4bQ7M729 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scn4bQ7M729 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scn4bQ7M729 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scn4bQ7M729 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scn4bQ7M729 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scn4bQ7M729 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scn4bQ7M729 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scn4bQ7M729 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Scn4bQ7M729 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Scn4bQ7M729 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scn4bQ7M729 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scn4bQ7M729 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scn4bQ7M729 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scn4bQ7M729 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scn4bQ7M729 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scn4bQ7M729 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scn4bQ7M729 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scn4bQ7M729 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scn4bQ7M729 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scn4bQ7M729 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scn4bQ7M729 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scn4bQ7M729 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scn4bQ7M729 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scn4bQ7M729 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Scn4bQ7M729 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Scn4bQ7M729 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scn4bQ7M729 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scn4bQ7M729 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Scn4bQ7M729 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scn4bQ7M729 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scn4bQ7M729 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scn4bQ7M729 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scn4bQ7M729 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scn4bQ7M729 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scn4bQ7M729 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Scn4bQ7M729 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scn4bQ7M729 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scn4bQ7M729 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scn4bQ7M729 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Scn4bQ7M729 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Scn4bQ7M729 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Scn4bQ7M729 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Scn4bQ7M729 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Scn4bQ7M729 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Scn4bQ7M729 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Scn4bQ7M729 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Scn4bQ7M729 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scn4bQ7M729 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scn4bQ7M729 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scn4bQ7M729 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scn4bQ7M729 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scn4bQ7M729 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scn4bQ7M729 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scn4bQ7M729 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scn4bQ7M729 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scn4bQ7M729 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scn4bQ7M729 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scn4bQ7M729 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scn4bQ7M729 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scn4bQ7M729 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scn4bQ7M729 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scn4bQ7M729 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Scn4bQ7M729 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Scn4bQ7M729 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scn4bQ7M729 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scn4bQ7M729 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scn4bQ7M729 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scn4bQ7M729 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scn4bQ7M729 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scn4bQ7M729 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scn4bQ7M729 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scn4bQ7M729 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scn4bQ7M729 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Scn4bQ7M729 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scn4bQ7M729 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scn4bQ7M729 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scn4bQ7M729 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scn4bQ7M729 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scn4bQ7M729 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scn4bQ7M729 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scn4bQ7M729 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scn4bQ7M729 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scn4bQ7M729 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scn4bQ7M729 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scn4bQ7M729 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scn4bQ7M729 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scn4bQ7M729 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scn4bQ7M729 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Scn4bQ7M729 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scn4bQ7M729 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Scn4bQ7M729 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scn4bQ7M729 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scn4bQ7M729 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scn4bQ7M729 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scn4bQ7M729 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scn4bQ7M729 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scn4bQ7M729 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scn4bQ7M729 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms