Protein–RNA interactions for Protein: Q78KK3

Slc22a18, Solute carrier family 22 member 18, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a18Q78KK3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Slc22a18Q78KK3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Slc22a18Q78KK3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Slc22a18Q78KK3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Slc22a18Q78KK3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Slc22a18Q78KK3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Slc22a18Q78KK3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Slc22a18Q78KK3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Slc22a18Q78KK3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Slc22a18Q78KK3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Slc22a18Q78KK3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Slc22a18Q78KK3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Slc22a18Q78KK3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Slc22a18Q78KK3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Slc22a18Q78KK3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Slc22a18Q78KK3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Slc22a18Q78KK3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Slc22a18Q78KK3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Slc22a18Q78KK3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Slc22a18Q78KK3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Slc22a18Q78KK3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Slc22a18Q78KK3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Slc22a18Q78KK3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Slc22a18Q78KK3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Slc22a18Q78KK3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Slc22a18Q78KK3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Slc22a18Q78KK3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Slc22a18Q78KK3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Slc22a18Q78KK3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Slc22a18Q78KK3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Slc22a18Q78KK3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Slc22a18Q78KK3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Slc22a18Q78KK3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Slc22a18Q78KK3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Slc22a18Q78KK3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Slc22a18Q78KK3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Slc22a18Q78KK3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Slc22a18Q78KK3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Slc22a18Q78KK3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Slc22a18Q78KK3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Slc22a18Q78KK3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Slc22a18Q78KK3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Slc22a18Q78KK3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Slc22a18Q78KK3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Slc22a18Q78KK3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Slc22a18Q78KK3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Slc22a18Q78KK3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Slc22a18Q78KK3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Slc22a18Q78KK3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Slc22a18Q78KK3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Slc22a18Q78KK3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Slc22a18Q78KK3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Slc22a18Q78KK3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Slc22a18Q78KK3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Slc22a18Q78KK3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Slc22a18Q78KK3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Slc22a18Q78KK3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Slc22a18Q78KK3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Slc22a18Q78KK3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Slc22a18Q78KK3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Slc22a18Q78KK3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Slc22a18Q78KK3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Slc22a18Q78KK3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Slc22a18Q78KK3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Slc22a18Q78KK3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Slc22a18Q78KK3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
Slc22a18Q78KK3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Slc22a18Q78KK3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Slc22a18Q78KK3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Slc22a18Q78KK3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Slc22a18Q78KK3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Slc22a18Q78KK3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Slc22a18Q78KK3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Slc22a18Q78KK3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Slc22a18Q78KK3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Slc22a18Q78KK3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Slc22a18Q78KK3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Slc22a18Q78KK3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Slc22a18Q78KK3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Slc22a18Q78KK3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Slc22a18Q78KK3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Slc22a18Q78KK3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Slc22a18Q78KK3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Slc22a18Q78KK3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Slc22a18Q78KK3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Slc22a18Q78KK3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Slc22a18Q78KK3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Slc22a18Q78KK3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Slc22a18Q78KK3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Slc22a18Q78KK3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Slc22a18Q78KK3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Slc22a18Q78KK3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Slc22a18Q78KK3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Slc22a18Q78KK3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Slc22a18Q78KK3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Slc22a18Q78KK3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Slc22a18Q78KK3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Slc22a18Q78KK3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Slc22a18Q78KK3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Slc22a18Q78KK3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms