Protein–RNA interactions for Protein: Q78HU3

Mvb12a, Multivesicular body subunit 12A, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mvb12aQ78HU3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Mvb12aQ78HU3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mvb12aQ78HU3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Mvb12aQ78HU3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Mvb12aQ78HU3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Mvb12aQ78HU3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Mvb12aQ78HU3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Mvb12aQ78HU3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Mvb12aQ78HU3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Mvb12aQ78HU3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Mvb12aQ78HU3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Mvb12aQ78HU3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Mvb12aQ78HU3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Mvb12aQ78HU3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Mvb12aQ78HU3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Mvb12aQ78HU3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Mvb12aQ78HU3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Mvb12aQ78HU3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Mvb12aQ78HU3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Mvb12aQ78HU3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mvb12aQ78HU3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mvb12aQ78HU3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Mvb12aQ78HU3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mvb12aQ78HU3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mvb12aQ78HU3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mvb12aQ78HU3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mvb12aQ78HU3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mvb12aQ78HU3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mvb12aQ78HU3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mvb12aQ78HU3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mvb12aQ78HU3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mvb12aQ78HU3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mvb12aQ78HU3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mvb12aQ78HU3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Mvb12aQ78HU3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mvb12aQ78HU3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mvb12aQ78HU3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mvb12aQ78HU3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mvb12aQ78HU3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mvb12aQ78HU3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mvb12aQ78HU3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mvb12aQ78HU3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Mvb12aQ78HU3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Mvb12aQ78HU3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Mvb12aQ78HU3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Mvb12aQ78HU3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Mvb12aQ78HU3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Mvb12aQ78HU3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mvb12aQ78HU3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mvb12aQ78HU3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Mvb12aQ78HU3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mvb12aQ78HU3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mvb12aQ78HU3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mvb12aQ78HU3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mvb12aQ78HU3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mvb12aQ78HU3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mvb12aQ78HU3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mvb12aQ78HU3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mvb12aQ78HU3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mvb12aQ78HU3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mvb12aQ78HU3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mvb12aQ78HU3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mvb12aQ78HU3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mvb12aQ78HU3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mvb12aQ78HU3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mvb12aQ78HU3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mvb12aQ78HU3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Mvb12aQ78HU3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Mvb12aQ78HU3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Mvb12aQ78HU3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Mvb12aQ78HU3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Mvb12aQ78HU3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mvb12aQ78HU3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mvb12aQ78HU3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mvb12aQ78HU3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mvb12aQ78HU3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mvb12aQ78HU3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Mvb12aQ78HU3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mvb12aQ78HU3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mvb12aQ78HU3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mvb12aQ78HU3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Mvb12aQ78HU3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mvb12aQ78HU3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Mvb12aQ78HU3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Mvb12aQ78HU3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mvb12aQ78HU3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mvb12aQ78HU3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mvb12aQ78HU3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mvb12aQ78HU3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Mvb12aQ78HU3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mvb12aQ78HU3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mvb12aQ78HU3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Mvb12aQ78HU3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mvb12aQ78HU3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mvb12aQ78HU3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Mvb12aQ78HU3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mvb12aQ78HU3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mvb12aQ78HU3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mvb12aQ78HU3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mvb12aQ78HU3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms