Protein–RNA interactions for Protein: Q76I79

Ssh1, Protein phosphatase Slingshot homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh1Q76I79 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ssh1Q76I79 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Ssh1Q76I79 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ssh1Q76I79 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ssh1Q76I79 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ssh1Q76I79 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ssh1Q76I79 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ssh1Q76I79 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ssh1Q76I79 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ssh1Q76I79 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ssh1Q76I79 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ssh1Q76I79 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Ssh1Q76I79 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ssh1Q76I79 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ssh1Q76I79 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ssh1Q76I79 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ssh1Q76I79 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ssh1Q76I79 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ssh1Q76I79 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Ssh1Q76I79 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ssh1Q76I79 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ssh1Q76I79 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ssh1Q76I79 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ssh1Q76I79 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ssh1Q76I79 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ssh1Q76I79 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ssh1Q76I79 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ssh1Q76I79 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ssh1Q76I79 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ssh1Q76I79 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ssh1Q76I79 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ssh1Q76I79 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ssh1Q76I79 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ssh1Q76I79 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ssh1Q76I79 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ssh1Q76I79 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ssh1Q76I79 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ssh1Q76I79 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Ssh1Q76I79 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ssh1Q76I79 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ssh1Q76I79 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ssh1Q76I79 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ssh1Q76I79 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ssh1Q76I79 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ssh1Q76I79 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ssh1Q76I79 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ssh1Q76I79 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ssh1Q76I79 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ssh1Q76I79 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ssh1Q76I79 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ssh1Q76I79 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ssh1Q76I79 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ssh1Q76I79 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ssh1Q76I79 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ssh1Q76I79 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ssh1Q76I79 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ssh1Q76I79 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ssh1Q76I79 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ssh1Q76I79 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ssh1Q76I79 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ssh1Q76I79 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ssh1Q76I79 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ssh1Q76I79 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ssh1Q76I79 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Ssh1Q76I79 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Ssh1Q76I79 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ssh1Q76I79 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ssh1Q76I79 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ssh1Q76I79 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ssh1Q76I79 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ssh1Q76I79 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ssh1Q76I79 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ssh1Q76I79 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ssh1Q76I79 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ssh1Q76I79 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ssh1Q76I79 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ssh1Q76I79 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ssh1Q76I79 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ssh1Q76I79 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ssh1Q76I79 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ssh1Q76I79 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ssh1Q76I79 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ssh1Q76I79 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ssh1Q76I79 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ssh1Q76I79 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ssh1Q76I79 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ssh1Q76I79 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ssh1Q76I79 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ssh1Q76I79 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ssh1Q76I79 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ssh1Q76I79 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ssh1Q76I79 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ssh1Q76I79 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ssh1Q76I79 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ssh1Q76I79 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ssh1Q76I79 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ssh1Q76I79 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ssh1Q76I79 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ssh1Q76I79 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ssh1Q76I79 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.7 ms