Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAR7

Ssxb10, MCG68110, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb10Q6XAR7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Ssxb10Q6XAR7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ssxb10Q6XAR7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ssxb10Q6XAR7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ssxb10Q6XAR7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ssxb10Q6XAR7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ssxb10Q6XAR7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ssxb10Q6XAR7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ssxb10Q6XAR7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ssxb10Q6XAR7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ssxb10Q6XAR7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ssxb10Q6XAR7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ssxb10Q6XAR7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ssxb10Q6XAR7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ssxb10Q6XAR7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ssxb10Q6XAR7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ssxb10Q6XAR7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ssxb10Q6XAR7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ssxb10Q6XAR7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ssxb10Q6XAR7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ssxb10Q6XAR7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ssxb10Q6XAR7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ssxb10Q6XAR7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ssxb10Q6XAR7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ssxb10Q6XAR7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ssxb10Q6XAR7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ssxb10Q6XAR7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ssxb10Q6XAR7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ssxb10Q6XAR7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ssxb10Q6XAR7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ssxb10Q6XAR7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ssxb10Q6XAR7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ssxb10Q6XAR7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ssxb10Q6XAR7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ssxb10Q6XAR7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ssxb10Q6XAR7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ssxb10Q6XAR7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ssxb10Q6XAR7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ssxb10Q6XAR7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ssxb10Q6XAR7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ssxb10Q6XAR7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ssxb10Q6XAR7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ssxb10Q6XAR7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ssxb10Q6XAR7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ssxb10Q6XAR7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ssxb10Q6XAR7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ssxb10Q6XAR7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ssxb10Q6XAR7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ssxb10Q6XAR7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ssxb10Q6XAR7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ssxb10Q6XAR7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ssxb10Q6XAR7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ssxb10Q6XAR7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ssxb10Q6XAR7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ssxb10Q6XAR7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ssxb10Q6XAR7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ssxb10Q6XAR7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ssxb10Q6XAR7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ssxb10Q6XAR7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ssxb10Q6XAR7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ssxb10Q6XAR7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ssxb10Q6XAR7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ssxb10Q6XAR7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ssxb10Q6XAR7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ssxb10Q6XAR7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ssxb10Q6XAR7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ssxb10Q6XAR7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ssxb10Q6XAR7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ssxb10Q6XAR7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ssxb10Q6XAR7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ssxb10Q6XAR7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Ssxb10Q6XAR7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Ssxb10Q6XAR7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ssxb10Q6XAR7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ssxb10Q6XAR7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ssxb10Q6XAR7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ssxb10Q6XAR7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ssxb10Q6XAR7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ssxb10Q6XAR7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ssxb10Q6XAR7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ssxb10Q6XAR7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ssxb10Q6XAR7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ssxb10Q6XAR7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ssxb10Q6XAR7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ssxb10Q6XAR7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ssxb10Q6XAR7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ssxb10Q6XAR7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ssxb10Q6XAR7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ssxb10Q6XAR7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ssxb10Q6XAR7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ssxb10Q6XAR7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ssxb10Q6XAR7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ssxb10Q6XAR7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ssxb10Q6XAR7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ssxb10Q6XAR7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ssxb10Q6XAR7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ssxb10Q6XAR7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ssxb10Q6XAR7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Ssxb10Q6XAR7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ssxb10Q6XAR7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
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