Protein–RNA interactions for Protein: Q6VUP9

Tfap2e, Transcription factor AP-2-epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2eQ6VUP9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tfap2eQ6VUP9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tfap2eQ6VUP9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tfap2eQ6VUP9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tfap2eQ6VUP9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tfap2eQ6VUP9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tfap2eQ6VUP9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tfap2eQ6VUP9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tfap2eQ6VUP9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tfap2eQ6VUP9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tfap2eQ6VUP9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Tfap2eQ6VUP9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tfap2eQ6VUP9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tfap2eQ6VUP9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tfap2eQ6VUP9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tfap2eQ6VUP9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Tfap2eQ6VUP9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tfap2eQ6VUP9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tfap2eQ6VUP9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tfap2eQ6VUP9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tfap2eQ6VUP9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tfap2eQ6VUP9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tfap2eQ6VUP9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tfap2eQ6VUP9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tfap2eQ6VUP9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Tfap2eQ6VUP9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tfap2eQ6VUP9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tfap2eQ6VUP9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tfap2eQ6VUP9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tfap2eQ6VUP9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tfap2eQ6VUP9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tfap2eQ6VUP9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tfap2eQ6VUP9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tfap2eQ6VUP9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tfap2eQ6VUP9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tfap2eQ6VUP9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tfap2eQ6VUP9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tfap2eQ6VUP9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tfap2eQ6VUP9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tfap2eQ6VUP9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tfap2eQ6VUP9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tfap2eQ6VUP9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tfap2eQ6VUP9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tfap2eQ6VUP9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Tfap2eQ6VUP9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tfap2eQ6VUP9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tfap2eQ6VUP9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tfap2eQ6VUP9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tfap2eQ6VUP9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tfap2eQ6VUP9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tfap2eQ6VUP9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tfap2eQ6VUP9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tfap2eQ6VUP9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tfap2eQ6VUP9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tfap2eQ6VUP9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tfap2eQ6VUP9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tfap2eQ6VUP9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tfap2eQ6VUP9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tfap2eQ6VUP9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tfap2eQ6VUP9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tfap2eQ6VUP9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tfap2eQ6VUP9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tfap2eQ6VUP9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tfap2eQ6VUP9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tfap2eQ6VUP9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tfap2eQ6VUP9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tfap2eQ6VUP9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tfap2eQ6VUP9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tfap2eQ6VUP9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tfap2eQ6VUP9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tfap2eQ6VUP9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tfap2eQ6VUP9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tfap2eQ6VUP9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tfap2eQ6VUP9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tfap2eQ6VUP9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tfap2eQ6VUP9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tfap2eQ6VUP9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tfap2eQ6VUP9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Tfap2eQ6VUP9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tfap2eQ6VUP9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tfap2eQ6VUP9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tfap2eQ6VUP9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tfap2eQ6VUP9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tfap2eQ6VUP9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tfap2eQ6VUP9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tfap2eQ6VUP9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tfap2eQ6VUP9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tfap2eQ6VUP9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tfap2eQ6VUP9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tfap2eQ6VUP9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tfap2eQ6VUP9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tfap2eQ6VUP9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tfap2eQ6VUP9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tfap2eQ6VUP9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tfap2eQ6VUP9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tfap2eQ6VUP9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tfap2eQ6VUP9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tfap2eQ6VUP9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tfap2eQ6VUP9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tfap2eQ6VUP9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms