Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIX5

Rhbdf1, Inactive rhomboid protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdf1Q6PIX5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rhbdf1Q6PIX5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rhbdf1Q6PIX5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Rhbdf1Q6PIX5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rhbdf1Q6PIX5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rhbdf1Q6PIX5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rhbdf1Q6PIX5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rhbdf1Q6PIX5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Rhbdf1Q6PIX5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rhbdf1Q6PIX5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rhbdf1Q6PIX5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rhbdf1Q6PIX5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rhbdf1Q6PIX5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rhbdf1Q6PIX5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rhbdf1Q6PIX5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rhbdf1Q6PIX5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rhbdf1Q6PIX5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rhbdf1Q6PIX5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rhbdf1Q6PIX5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rhbdf1Q6PIX5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rhbdf1Q6PIX5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rhbdf1Q6PIX5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rhbdf1Q6PIX5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rhbdf1Q6PIX5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rhbdf1Q6PIX5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rhbdf1Q6PIX5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Rhbdf1Q6PIX5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rhbdf1Q6PIX5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rhbdf1Q6PIX5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rhbdf1Q6PIX5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rhbdf1Q6PIX5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rhbdf1Q6PIX5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rhbdf1Q6PIX5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rhbdf1Q6PIX5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rhbdf1Q6PIX5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rhbdf1Q6PIX5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rhbdf1Q6PIX5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Rhbdf1Q6PIX5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rhbdf1Q6PIX5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rhbdf1Q6PIX5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rhbdf1Q6PIX5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rhbdf1Q6PIX5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rhbdf1Q6PIX5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rhbdf1Q6PIX5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rhbdf1Q6PIX5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rhbdf1Q6PIX5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rhbdf1Q6PIX5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rhbdf1Q6PIX5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rhbdf1Q6PIX5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rhbdf1Q6PIX5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rhbdf1Q6PIX5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rhbdf1Q6PIX5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rhbdf1Q6PIX5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rhbdf1Q6PIX5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rhbdf1Q6PIX5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rhbdf1Q6PIX5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Rhbdf1Q6PIX5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Rhbdf1Q6PIX5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rhbdf1Q6PIX5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rhbdf1Q6PIX5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Rhbdf1Q6PIX5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rhbdf1Q6PIX5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rhbdf1Q6PIX5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rhbdf1Q6PIX5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rhbdf1Q6PIX5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rhbdf1Q6PIX5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rhbdf1Q6PIX5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rhbdf1Q6PIX5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rhbdf1Q6PIX5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rhbdf1Q6PIX5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rhbdf1Q6PIX5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rhbdf1Q6PIX5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rhbdf1Q6PIX5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rhbdf1Q6PIX5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rhbdf1Q6PIX5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rhbdf1Q6PIX5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Rhbdf1Q6PIX5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rhbdf1Q6PIX5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rhbdf1Q6PIX5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rhbdf1Q6PIX5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Rhbdf1Q6PIX5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rhbdf1Q6PIX5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rhbdf1Q6PIX5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rhbdf1Q6PIX5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rhbdf1Q6PIX5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rhbdf1Q6PIX5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rhbdf1Q6PIX5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rhbdf1Q6PIX5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rhbdf1Q6PIX5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rhbdf1Q6PIX5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rhbdf1Q6PIX5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rhbdf1Q6PIX5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rhbdf1Q6PIX5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rhbdf1Q6PIX5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rhbdf1Q6PIX5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rhbdf1Q6PIX5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rhbdf1Q6PIX5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rhbdf1Q6PIX5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rhbdf1Q6PIX5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rhbdf1Q6PIX5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms