Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGH0

Ubtd2, Ubiquitin domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubtd2Q6PGH0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ubtd2Q6PGH0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ubtd2Q6PGH0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ubtd2Q6PGH0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ubtd2Q6PGH0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ubtd2Q6PGH0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ubtd2Q6PGH0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ubtd2Q6PGH0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ubtd2Q6PGH0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ubtd2Q6PGH0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ubtd2Q6PGH0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ubtd2Q6PGH0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ubtd2Q6PGH0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ubtd2Q6PGH0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ubtd2Q6PGH0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ubtd2Q6PGH0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ubtd2Q6PGH0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ubtd2Q6PGH0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ubtd2Q6PGH0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ubtd2Q6PGH0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ubtd2Q6PGH0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ubtd2Q6PGH0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ubtd2Q6PGH0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ubtd2Q6PGH0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ubtd2Q6PGH0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ubtd2Q6PGH0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ubtd2Q6PGH0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ubtd2Q6PGH0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ubtd2Q6PGH0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ubtd2Q6PGH0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ubtd2Q6PGH0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ubtd2Q6PGH0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ubtd2Q6PGH0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ubtd2Q6PGH0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ubtd2Q6PGH0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ubtd2Q6PGH0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ubtd2Q6PGH0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ubtd2Q6PGH0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ubtd2Q6PGH0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ubtd2Q6PGH0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ubtd2Q6PGH0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ubtd2Q6PGH0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ubtd2Q6PGH0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ubtd2Q6PGH0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ubtd2Q6PGH0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ubtd2Q6PGH0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ubtd2Q6PGH0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ubtd2Q6PGH0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ubtd2Q6PGH0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ubtd2Q6PGH0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Ubtd2Q6PGH0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ubtd2Q6PGH0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ubtd2Q6PGH0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ubtd2Q6PGH0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ubtd2Q6PGH0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ubtd2Q6PGH0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ubtd2Q6PGH0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ubtd2Q6PGH0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ubtd2Q6PGH0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ubtd2Q6PGH0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ubtd2Q6PGH0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ubtd2Q6PGH0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ubtd2Q6PGH0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ubtd2Q6PGH0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ubtd2Q6PGH0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ubtd2Q6PGH0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ubtd2Q6PGH0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ubtd2Q6PGH0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ubtd2Q6PGH0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ubtd2Q6PGH0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ubtd2Q6PGH0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ubtd2Q6PGH0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ubtd2Q6PGH0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ubtd2Q6PGH0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ubtd2Q6PGH0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ubtd2Q6PGH0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ubtd2Q6PGH0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ubtd2Q6PGH0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ubtd2Q6PGH0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ubtd2Q6PGH0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ubtd2Q6PGH0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ubtd2Q6PGH0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ubtd2Q6PGH0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ubtd2Q6PGH0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ubtd2Q6PGH0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ubtd2Q6PGH0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ubtd2Q6PGH0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ubtd2Q6PGH0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ubtd2Q6PGH0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ubtd2Q6PGH0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ubtd2Q6PGH0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ubtd2Q6PGH0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ubtd2Q6PGH0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ubtd2Q6PGH0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ubtd2Q6PGH0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ubtd2Q6PGH0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ubtd2Q6PGH0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ubtd2Q6PGH0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ubtd2Q6PGH0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ubtd2Q6PGH0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms