Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF93

Pik3c3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3c3Q6PF93 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pik3c3Q6PF93 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pik3c3Q6PF93 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pik3c3Q6PF93 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pik3c3Q6PF93 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pik3c3Q6PF93 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pik3c3Q6PF93 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pik3c3Q6PF93 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pik3c3Q6PF93 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pik3c3Q6PF93 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pik3c3Q6PF93 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pik3c3Q6PF93 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pik3c3Q6PF93 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pik3c3Q6PF93 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pik3c3Q6PF93 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pik3c3Q6PF93 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pik3c3Q6PF93 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pik3c3Q6PF93 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pik3c3Q6PF93 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pik3c3Q6PF93 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pik3c3Q6PF93 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pik3c3Q6PF93 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pik3c3Q6PF93 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pik3c3Q6PF93 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pik3c3Q6PF93 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pik3c3Q6PF93 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pik3c3Q6PF93 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pik3c3Q6PF93 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pik3c3Q6PF93 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pik3c3Q6PF93 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pik3c3Q6PF93 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pik3c3Q6PF93 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pik3c3Q6PF93 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pik3c3Q6PF93 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pik3c3Q6PF93 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pik3c3Q6PF93 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pik3c3Q6PF93 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pik3c3Q6PF93 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pik3c3Q6PF93 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pik3c3Q6PF93 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pik3c3Q6PF93 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pik3c3Q6PF93 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pik3c3Q6PF93 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pik3c3Q6PF93 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pik3c3Q6PF93 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pik3c3Q6PF93 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pik3c3Q6PF93 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pik3c3Q6PF93 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pik3c3Q6PF93 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pik3c3Q6PF93 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Pik3c3Q6PF93 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pik3c3Q6PF93 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Pik3c3Q6PF93 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pik3c3Q6PF93 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pik3c3Q6PF93 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pik3c3Q6PF93 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pik3c3Q6PF93 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pik3c3Q6PF93 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pik3c3Q6PF93 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pik3c3Q6PF93 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pik3c3Q6PF93 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pik3c3Q6PF93 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pik3c3Q6PF93 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pik3c3Q6PF93 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pik3c3Q6PF93 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pik3c3Q6PF93 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pik3c3Q6PF93 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Pik3c3Q6PF93 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pik3c3Q6PF93 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pik3c3Q6PF93 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pik3c3Q6PF93 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pik3c3Q6PF93 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Pik3c3Q6PF93 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pik3c3Q6PF93 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pik3c3Q6PF93 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pik3c3Q6PF93 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pik3c3Q6PF93 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pik3c3Q6PF93 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Pik3c3Q6PF93 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pik3c3Q6PF93 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Pik3c3Q6PF93 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pik3c3Q6PF93 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pik3c3Q6PF93 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pik3c3Q6PF93 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pik3c3Q6PF93 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pik3c3Q6PF93 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pik3c3Q6PF93 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pik3c3Q6PF93 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pik3c3Q6PF93 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pik3c3Q6PF93 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Pik3c3Q6PF93 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pik3c3Q6PF93 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pik3c3Q6PF93 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pik3c3Q6PF93 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pik3c3Q6PF93 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pik3c3Q6PF93 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pik3c3Q6PF93 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Pik3c3Q6PF93 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pik3c3Q6PF93 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pik3c3Q6PF93 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms