Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB51

Ccdc117, Coiled-coil domain-containing protein 117, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc117Q6PB51 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ccdc117Q6PB51 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ccdc117Q6PB51 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc117Q6PB51 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc117Q6PB51 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc117Q6PB51 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc117Q6PB51 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc117Q6PB51 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc117Q6PB51 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc117Q6PB51 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc117Q6PB51 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc117Q6PB51 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc117Q6PB51 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc117Q6PB51 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc117Q6PB51 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc117Q6PB51 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc117Q6PB51 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc117Q6PB51 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc117Q6PB51 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc117Q6PB51 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc117Q6PB51 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc117Q6PB51 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc117Q6PB51 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc117Q6PB51 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc117Q6PB51 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc117Q6PB51 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc117Q6PB51 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc117Q6PB51 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc117Q6PB51 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc117Q6PB51 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc117Q6PB51 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc117Q6PB51 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc117Q6PB51 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc117Q6PB51 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc117Q6PB51 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc117Q6PB51 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc117Q6PB51 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc117Q6PB51 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc117Q6PB51 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc117Q6PB51 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc117Q6PB51 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc117Q6PB51 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc117Q6PB51 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc117Q6PB51 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc117Q6PB51 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc117Q6PB51 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc117Q6PB51 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc117Q6PB51 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc117Q6PB51 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc117Q6PB51 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc117Q6PB51 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc117Q6PB51 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc117Q6PB51 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc117Q6PB51 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc117Q6PB51 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc117Q6PB51 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc117Q6PB51 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc117Q6PB51 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc117Q6PB51 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc117Q6PB51 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc117Q6PB51 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc117Q6PB51 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc117Q6PB51 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc117Q6PB51 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc117Q6PB51 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc117Q6PB51 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc117Q6PB51 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc117Q6PB51 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc117Q6PB51 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc117Q6PB51 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc117Q6PB51 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc117Q6PB51 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc117Q6PB51 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc117Q6PB51 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc117Q6PB51 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc117Q6PB51 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc117Q6PB51 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc117Q6PB51 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc117Q6PB51 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc117Q6PB51 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc117Q6PB51 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc117Q6PB51 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc117Q6PB51 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc117Q6PB51 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc117Q6PB51 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc117Q6PB51 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc117Q6PB51 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc117Q6PB51 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc117Q6PB51 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc117Q6PB51 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc117Q6PB51 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc117Q6PB51 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc117Q6PB51 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc117Q6PB51 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc117Q6PB51 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc117Q6PB51 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc117Q6PB51 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc117Q6PB51 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc117Q6PB51 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc117Q6PB51 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 168.5 ms