Protein–RNA interactions for Protein: Q6P542

Abcf1, ATP-binding cassette sub-family F member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf1Q6P542 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Abcf1Q6P542 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Abcf1Q6P542 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Abcf1Q6P542 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Abcf1Q6P542 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Abcf1Q6P542 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Abcf1Q6P542 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Abcf1Q6P542 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Abcf1Q6P542 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Abcf1Q6P542 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Abcf1Q6P542 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Abcf1Q6P542 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Abcf1Q6P542 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Abcf1Q6P542 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Abcf1Q6P542 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Abcf1Q6P542 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Abcf1Q6P542 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Abcf1Q6P542 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Abcf1Q6P542 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Abcf1Q6P542 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Abcf1Q6P542 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Abcf1Q6P542 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Abcf1Q6P542 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Abcf1Q6P542 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Abcf1Q6P542 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Abcf1Q6P542 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Abcf1Q6P542 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Abcf1Q6P542 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Abcf1Q6P542 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Abcf1Q6P542 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Abcf1Q6P542 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Abcf1Q6P542 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Abcf1Q6P542 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Abcf1Q6P542 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Abcf1Q6P542 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Abcf1Q6P542 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Abcf1Q6P542 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Abcf1Q6P542 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Abcf1Q6P542 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Abcf1Q6P542 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Abcf1Q6P542 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Abcf1Q6P542 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Abcf1Q6P542 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Abcf1Q6P542 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Abcf1Q6P542 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Abcf1Q6P542 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Abcf1Q6P542 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Abcf1Q6P542 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Abcf1Q6P542 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Abcf1Q6P542 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Abcf1Q6P542 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Abcf1Q6P542 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Abcf1Q6P542 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Abcf1Q6P542 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Abcf1Q6P542 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Abcf1Q6P542 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Abcf1Q6P542 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Abcf1Q6P542 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Abcf1Q6P542 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Abcf1Q6P542 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Abcf1Q6P542 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Abcf1Q6P542 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Abcf1Q6P542 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Abcf1Q6P542 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Abcf1Q6P542 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Abcf1Q6P542 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Abcf1Q6P542 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Abcf1Q6P542 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Abcf1Q6P542 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Abcf1Q6P542 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Abcf1Q6P542 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Abcf1Q6P542 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Abcf1Q6P542 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Abcf1Q6P542 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Abcf1Q6P542 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Abcf1Q6P542 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Abcf1Q6P542 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Abcf1Q6P542 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Abcf1Q6P542 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Abcf1Q6P542 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Abcf1Q6P542 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Abcf1Q6P542 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Abcf1Q6P542 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Abcf1Q6P542 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Abcf1Q6P542 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Abcf1Q6P542 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Abcf1Q6P542 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Abcf1Q6P542 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Abcf1Q6P542 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Abcf1Q6P542 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Abcf1Q6P542 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Abcf1Q6P542 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Abcf1Q6P542 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Abcf1Q6P542 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Abcf1Q6P542 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Abcf1Q6P542 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Abcf1Q6P542 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Abcf1Q6P542 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Abcf1Q6P542 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Abcf1Q6P542 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms