Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZK8

Ptpdc1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpdc1Q6NZK8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ptpdc1Q6NZK8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ptpdc1Q6NZK8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ptpdc1Q6NZK8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ptpdc1Q6NZK8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ptpdc1Q6NZK8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ptpdc1Q6NZK8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ptpdc1Q6NZK8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ptpdc1Q6NZK8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ptpdc1Q6NZK8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ptpdc1Q6NZK8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ptpdc1Q6NZK8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ptpdc1Q6NZK8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ptpdc1Q6NZK8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ptpdc1Q6NZK8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ptpdc1Q6NZK8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Ptpdc1Q6NZK8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ptpdc1Q6NZK8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ptpdc1Q6NZK8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.2
Ptpdc1Q6NZK8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ptpdc1Q6NZK8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ptpdc1Q6NZK8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Ptpdc1Q6NZK8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ptpdc1Q6NZK8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ptpdc1Q6NZK8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ptpdc1Q6NZK8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ptpdc1Q6NZK8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ptpdc1Q6NZK8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Ptpdc1Q6NZK8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ptpdc1Q6NZK8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Ptpdc1Q6NZK8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Ptpdc1Q6NZK8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Ptpdc1Q6NZK8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ptpdc1Q6NZK8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ptpdc1Q6NZK8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ptpdc1Q6NZK8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ptpdc1Q6NZK8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ptpdc1Q6NZK8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ptpdc1Q6NZK8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ptpdc1Q6NZK8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ptpdc1Q6NZK8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ptpdc1Q6NZK8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ptpdc1Q6NZK8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ptpdc1Q6NZK8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Ptpdc1Q6NZK8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ptpdc1Q6NZK8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ptpdc1Q6NZK8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ptpdc1Q6NZK8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ptpdc1Q6NZK8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ptpdc1Q6NZK8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ptpdc1Q6NZK8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ptpdc1Q6NZK8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ptpdc1Q6NZK8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Ptpdc1Q6NZK8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ptpdc1Q6NZK8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ptpdc1Q6NZK8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Ptpdc1Q6NZK8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Ptpdc1Q6NZK8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ptpdc1Q6NZK8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ptpdc1Q6NZK8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ptpdc1Q6NZK8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Ptpdc1Q6NZK8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ptpdc1Q6NZK8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ptpdc1Q6NZK8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ptpdc1Q6NZK8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ptpdc1Q6NZK8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ptpdc1Q6NZK8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ptpdc1Q6NZK8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ptpdc1Q6NZK8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ptpdc1Q6NZK8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ptpdc1Q6NZK8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ptpdc1Q6NZK8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ptpdc1Q6NZK8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ptpdc1Q6NZK8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ptpdc1Q6NZK8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ptpdc1Q6NZK8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ptpdc1Q6NZK8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ptpdc1Q6NZK8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Ptpdc1Q6NZK8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ptpdc1Q6NZK8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ptpdc1Q6NZK8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ptpdc1Q6NZK8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ptpdc1Q6NZK8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ptpdc1Q6NZK8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ptpdc1Q6NZK8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ptpdc1Q6NZK8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ptpdc1Q6NZK8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ptpdc1Q6NZK8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ptpdc1Q6NZK8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ptpdc1Q6NZK8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ptpdc1Q6NZK8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ptpdc1Q6NZK8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ptpdc1Q6NZK8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ptpdc1Q6NZK8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ptpdc1Q6NZK8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ptpdc1Q6NZK8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ptpdc1Q6NZK8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ptpdc1Q6NZK8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ptpdc1Q6NZK8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ptpdc1Q6NZK8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms