Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVD9

Bfsp2, Phakinin, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bfsp2Q6NVD9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Bfsp2Q6NVD9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Bfsp2Q6NVD9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Bfsp2Q6NVD9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Bfsp2Q6NVD9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Bfsp2Q6NVD9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Bfsp2Q6NVD9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Bfsp2Q6NVD9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Bfsp2Q6NVD9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Bfsp2Q6NVD9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Bfsp2Q6NVD9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Bfsp2Q6NVD9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Bfsp2Q6NVD9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Bfsp2Q6NVD9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Bfsp2Q6NVD9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Bfsp2Q6NVD9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Bfsp2Q6NVD9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Bfsp2Q6NVD9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Bfsp2Q6NVD9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Bfsp2Q6NVD9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Bfsp2Q6NVD9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Bfsp2Q6NVD9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Bfsp2Q6NVD9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Bfsp2Q6NVD9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Bfsp2Q6NVD9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Bfsp2Q6NVD9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Bfsp2Q6NVD9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Bfsp2Q6NVD9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Bfsp2Q6NVD9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Bfsp2Q6NVD9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Bfsp2Q6NVD9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Bfsp2Q6NVD9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Bfsp2Q6NVD9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Bfsp2Q6NVD9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Bfsp2Q6NVD9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Bfsp2Q6NVD9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Bfsp2Q6NVD9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Bfsp2Q6NVD9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Bfsp2Q6NVD9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Bfsp2Q6NVD9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Bfsp2Q6NVD9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Bfsp2Q6NVD9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Bfsp2Q6NVD9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Bfsp2Q6NVD9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Bfsp2Q6NVD9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Bfsp2Q6NVD9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Bfsp2Q6NVD9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Bfsp2Q6NVD9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Bfsp2Q6NVD9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Bfsp2Q6NVD9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Bfsp2Q6NVD9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Bfsp2Q6NVD9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Bfsp2Q6NVD9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Bfsp2Q6NVD9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Bfsp2Q6NVD9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Bfsp2Q6NVD9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Bfsp2Q6NVD9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Bfsp2Q6NVD9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Bfsp2Q6NVD9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Bfsp2Q6NVD9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Bfsp2Q6NVD9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Bfsp2Q6NVD9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Bfsp2Q6NVD9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Bfsp2Q6NVD9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Bfsp2Q6NVD9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Bfsp2Q6NVD9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Bfsp2Q6NVD9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Bfsp2Q6NVD9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Bfsp2Q6NVD9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Bfsp2Q6NVD9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Bfsp2Q6NVD9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Bfsp2Q6NVD9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Bfsp2Q6NVD9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Bfsp2Q6NVD9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Bfsp2Q6NVD9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Bfsp2Q6NVD9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Bfsp2Q6NVD9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Bfsp2Q6NVD9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Bfsp2Q6NVD9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Bfsp2Q6NVD9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Bfsp2Q6NVD9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Bfsp2Q6NVD9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Bfsp2Q6NVD9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Bfsp2Q6NVD9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Bfsp2Q6NVD9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Bfsp2Q6NVD9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Bfsp2Q6NVD9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Bfsp2Q6NVD9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Bfsp2Q6NVD9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Bfsp2Q6NVD9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Bfsp2Q6NVD9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Bfsp2Q6NVD9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Bfsp2Q6NVD9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Bfsp2Q6NVD9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Bfsp2Q6NVD9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Bfsp2Q6NVD9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Bfsp2Q6NVD9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Bfsp2Q6NVD9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Bfsp2Q6NVD9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Bfsp2Q6NVD9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms