Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS46

Pdcd11, Protein RRP5 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd11Q6NS46 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Pdcd11Q6NS46 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
Pdcd11Q6NS46 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
Pdcd11Q6NS46 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Pdcd11Q6NS46 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Pdcd11Q6NS46 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Pdcd11Q6NS46 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Pdcd11Q6NS46 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Pdcd11Q6NS46 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
Pdcd11Q6NS46 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
Pdcd11Q6NS46 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Pdcd11Q6NS46 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
Pdcd11Q6NS46 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC35.82■■■■□ 3.33
Pdcd11Q6NS46 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Pdcd11Q6NS46 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
Pdcd11Q6NS46 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
Pdcd11Q6NS46 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Pdcd11Q6NS46 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Pdcd11Q6NS46 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Pdcd11Q6NS46 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Pdcd11Q6NS46 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Pdcd11Q6NS46 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Pdcd11Q6NS46 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Pdcd11Q6NS46 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Pdcd11Q6NS46 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Pdcd11Q6NS46 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Pdcd11Q6NS46 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Pdcd11Q6NS46 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Pdcd11Q6NS46 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
Pdcd11Q6NS46 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Pdcd11Q6NS46 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
Pdcd11Q6NS46 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Pdcd11Q6NS46 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Pdcd11Q6NS46 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Pdcd11Q6NS46 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Pdcd11Q6NS46 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Pdcd11Q6NS46 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Pdcd11Q6NS46 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Pdcd11Q6NS46 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Pdcd11Q6NS46 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
Pdcd11Q6NS46 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
Pdcd11Q6NS46 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Pdcd11Q6NS46 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Pdcd11Q6NS46 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
Pdcd11Q6NS46 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Pdcd11Q6NS46 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Pdcd11Q6NS46 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Pdcd11Q6NS46 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Pdcd11Q6NS46 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
Pdcd11Q6NS46 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Pdcd11Q6NS46 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Pdcd11Q6NS46 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
Pdcd11Q6NS46 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Pdcd11Q6NS46 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Pdcd11Q6NS46 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC35.57■■■■□ 3.29
Pdcd11Q6NS46 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
Pdcd11Q6NS46 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Pdcd11Q6NS46 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Pdcd11Q6NS46 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Pdcd11Q6NS46 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Pdcd11Q6NS46 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Pdcd11Q6NS46 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Pdcd11Q6NS46 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
Pdcd11Q6NS46 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Pdcd11Q6NS46 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
Pdcd11Q6NS46 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
Pdcd11Q6NS46 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Pdcd11Q6NS46 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Pdcd11Q6NS46 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Pdcd11Q6NS46 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
Pdcd11Q6NS46 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Pdcd11Q6NS46 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
Pdcd11Q6NS46 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
Pdcd11Q6NS46 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Pdcd11Q6NS46 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Pdcd11Q6NS46 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
Pdcd11Q6NS46 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
Pdcd11Q6NS46 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Pdcd11Q6NS46 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
Pdcd11Q6NS46 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Pdcd11Q6NS46 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Pdcd11Q6NS46 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Pdcd11Q6NS46 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Pdcd11Q6NS46 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC35.47■■■■□ 3.27
Pdcd11Q6NS46 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
Pdcd11Q6NS46 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
Pdcd11Q6NS46 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Pdcd11Q6NS46 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Pdcd11Q6NS46 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
Pdcd11Q6NS46 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Pdcd11Q6NS46 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
Pdcd11Q6NS46 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Pdcd11Q6NS46 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
Pdcd11Q6NS46 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Pdcd11Q6NS46 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
Pdcd11Q6NS46 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Pdcd11Q6NS46 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC35.38■■■■□ 3.25
Pdcd11Q6NS46 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
Pdcd11Q6NS46 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
Pdcd11Q6NS46 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms