Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS45

Ccdc66, Coiled-coil domain-containing protein 66, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc66Q6NS45 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc66Q6NS45 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc66Q6NS45 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc66Q6NS45 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc66Q6NS45 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc66Q6NS45 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc66Q6NS45 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc66Q6NS45 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc66Q6NS45 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc66Q6NS45 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc66Q6NS45 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc66Q6NS45 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc66Q6NS45 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc66Q6NS45 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc66Q6NS45 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ccdc66Q6NS45 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ccdc66Q6NS45 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc66Q6NS45 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc66Q6NS45 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc66Q6NS45 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc66Q6NS45 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc66Q6NS45 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc66Q6NS45 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc66Q6NS45 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc66Q6NS45 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc66Q6NS45 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc66Q6NS45 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc66Q6NS45 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc66Q6NS45 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc66Q6NS45 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc66Q6NS45 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc66Q6NS45 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ccdc66Q6NS45 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ccdc66Q6NS45 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ccdc66Q6NS45 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc66Q6NS45 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc66Q6NS45 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc66Q6NS45 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc66Q6NS45 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc66Q6NS45 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc66Q6NS45 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc66Q6NS45 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc66Q6NS45 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc66Q6NS45 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc66Q6NS45 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc66Q6NS45 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc66Q6NS45 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc66Q6NS45 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc66Q6NS45 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc66Q6NS45 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc66Q6NS45 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc66Q6NS45 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc66Q6NS45 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc66Q6NS45 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc66Q6NS45 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc66Q6NS45 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc66Q6NS45 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc66Q6NS45 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc66Q6NS45 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc66Q6NS45 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc66Q6NS45 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc66Q6NS45 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc66Q6NS45 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc66Q6NS45 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc66Q6NS45 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc66Q6NS45 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc66Q6NS45 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc66Q6NS45 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc66Q6NS45 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc66Q6NS45 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc66Q6NS45 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc66Q6NS45 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc66Q6NS45 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc66Q6NS45 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc66Q6NS45 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc66Q6NS45 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc66Q6NS45 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc66Q6NS45 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc66Q6NS45 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc66Q6NS45 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc66Q6NS45 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc66Q6NS45 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc66Q6NS45 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc66Q6NS45 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc66Q6NS45 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc66Q6NS45 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc66Q6NS45 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc66Q6NS45 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc66Q6NS45 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc66Q6NS45 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc66Q6NS45 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc66Q6NS45 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc66Q6NS45 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc66Q6NS45 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc66Q6NS45 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc66Q6NS45 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc66Q6NS45 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ccdc66Q6NS45 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ccdc66Q6NS45 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccdc66Q6NS45 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms