Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ParpbpQ6IRT3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ParpbpQ6IRT3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ParpbpQ6IRT3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ParpbpQ6IRT3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ParpbpQ6IRT3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ParpbpQ6IRT3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ParpbpQ6IRT3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ParpbpQ6IRT3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ParpbpQ6IRT3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ParpbpQ6IRT3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ParpbpQ6IRT3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ParpbpQ6IRT3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ParpbpQ6IRT3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ParpbpQ6IRT3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ParpbpQ6IRT3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ParpbpQ6IRT3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ParpbpQ6IRT3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ParpbpQ6IRT3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ParpbpQ6IRT3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ParpbpQ6IRT3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ParpbpQ6IRT3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ParpbpQ6IRT3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ParpbpQ6IRT3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ParpbpQ6IRT3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ParpbpQ6IRT3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ParpbpQ6IRT3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ParpbpQ6IRT3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ParpbpQ6IRT3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ParpbpQ6IRT3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ParpbpQ6IRT3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ParpbpQ6IRT3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ParpbpQ6IRT3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ParpbpQ6IRT3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ParpbpQ6IRT3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ParpbpQ6IRT3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ParpbpQ6IRT3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ParpbpQ6IRT3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ParpbpQ6IRT3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ParpbpQ6IRT3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ParpbpQ6IRT3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ParpbpQ6IRT3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ParpbpQ6IRT3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ParpbpQ6IRT3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ParpbpQ6IRT3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ParpbpQ6IRT3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ParpbpQ6IRT3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ParpbpQ6IRT3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ParpbpQ6IRT3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ParpbpQ6IRT3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ParpbpQ6IRT3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ParpbpQ6IRT3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ParpbpQ6IRT3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ParpbpQ6IRT3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ParpbpQ6IRT3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ParpbpQ6IRT3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ParpbpQ6IRT3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ParpbpQ6IRT3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ParpbpQ6IRT3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ParpbpQ6IRT3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ParpbpQ6IRT3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ParpbpQ6IRT3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ParpbpQ6IRT3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ParpbpQ6IRT3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ParpbpQ6IRT3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ParpbpQ6IRT3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ParpbpQ6IRT3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ParpbpQ6IRT3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ParpbpQ6IRT3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ParpbpQ6IRT3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ParpbpQ6IRT3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ParpbpQ6IRT3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ParpbpQ6IRT3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ParpbpQ6IRT3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ParpbpQ6IRT3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ParpbpQ6IRT3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ParpbpQ6IRT3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ParpbpQ6IRT3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ParpbpQ6IRT3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ParpbpQ6IRT3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ParpbpQ6IRT3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ParpbpQ6IRT3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ParpbpQ6IRT3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ParpbpQ6IRT3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ParpbpQ6IRT3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ParpbpQ6IRT3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ParpbpQ6IRT3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ParpbpQ6IRT3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ParpbpQ6IRT3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ParpbpQ6IRT3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ParpbpQ6IRT3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ParpbpQ6IRT3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ParpbpQ6IRT3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ParpbpQ6IRT3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ParpbpQ6IRT3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ParpbpQ6IRT3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ParpbpQ6IRT3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ParpbpQ6IRT3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ParpbpQ6IRT3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ParpbpQ6IRT3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms