Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Krt39Q6IFX4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Krt39Q6IFX4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Krt39Q6IFX4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Krt39Q6IFX4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Krt39Q6IFX4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Krt39Q6IFX4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Krt39Q6IFX4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Krt39Q6IFX4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Krt39Q6IFX4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Krt39Q6IFX4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Krt39Q6IFX4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Krt39Q6IFX4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Krt39Q6IFX4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Krt39Q6IFX4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Krt39Q6IFX4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Krt39Q6IFX4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Krt39Q6IFX4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Krt39Q6IFX4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Krt39Q6IFX4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Krt39Q6IFX4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Krt39Q6IFX4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Krt39Q6IFX4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Krt39Q6IFX4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Krt39Q6IFX4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Krt39Q6IFX4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Krt39Q6IFX4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Krt39Q6IFX4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Krt39Q6IFX4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Krt39Q6IFX4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Krt39Q6IFX4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Krt39Q6IFX4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Krt39Q6IFX4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Krt39Q6IFX4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Krt39Q6IFX4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Krt39Q6IFX4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Krt39Q6IFX4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Krt39Q6IFX4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Krt39Q6IFX4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Krt39Q6IFX4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Krt39Q6IFX4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Krt39Q6IFX4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Krt39Q6IFX4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Krt39Q6IFX4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Krt39Q6IFX4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Krt39Q6IFX4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Krt39Q6IFX4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Krt39Q6IFX4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Krt39Q6IFX4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Krt39Q6IFX4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Krt39Q6IFX4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Krt39Q6IFX4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Krt39Q6IFX4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Krt39Q6IFX4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Krt39Q6IFX4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Krt39Q6IFX4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Krt39Q6IFX4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Krt39Q6IFX4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Krt39Q6IFX4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Krt39Q6IFX4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Krt39Q6IFX4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Krt39Q6IFX4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Krt39Q6IFX4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Krt39Q6IFX4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Krt39Q6IFX4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Krt39Q6IFX4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Krt39Q6IFX4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Krt39Q6IFX4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Krt39Q6IFX4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Krt39Q6IFX4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Krt39Q6IFX4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Krt39Q6IFX4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Krt39Q6IFX4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Krt39Q6IFX4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Krt39Q6IFX4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Krt39Q6IFX4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Krt39Q6IFX4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Krt39Q6IFX4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Krt39Q6IFX4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Krt39Q6IFX4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Krt39Q6IFX4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Krt39Q6IFX4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Krt39Q6IFX4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Krt39Q6IFX4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Krt39Q6IFX4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Krt39Q6IFX4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Krt39Q6IFX4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Krt39Q6IFX4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Krt39Q6IFX4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Krt39Q6IFX4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Krt39Q6IFX4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Krt39Q6IFX4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Krt39Q6IFX4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Krt39Q6IFX4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Krt39Q6IFX4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Krt39Q6IFX4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Krt39Q6IFX4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Krt39Q6IFX4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Krt39Q6IFX4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Krt39Q6IFX4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms