Protein–RNA interactions for Protein: Q6GSS7

Hist2h2aa1, Histone H2A type 2-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hist2h2aa1Q6GSS7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hist2h2aa1Q6GSS7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hist2h2aa1Q6GSS7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hist2h2aa1Q6GSS7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hist2h2aa1Q6GSS7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hist2h2aa1Q6GSS7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hist2h2aa1Q6GSS7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hist2h2aa1Q6GSS7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hist2h2aa1Q6GSS7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hist2h2aa1Q6GSS7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hist2h2aa1Q6GSS7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hist2h2aa1Q6GSS7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hist2h2aa1Q6GSS7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hist2h2aa1Q6GSS7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hist2h2aa1Q6GSS7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hist2h2aa1Q6GSS7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hist2h2aa1Q6GSS7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hist2h2aa1Q6GSS7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hist2h2aa1Q6GSS7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hist2h2aa1Q6GSS7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hist2h2aa1Q6GSS7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hist2h2aa1Q6GSS7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Hist2h2aa1Q6GSS7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hist2h2aa1Q6GSS7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hist2h2aa1Q6GSS7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hist2h2aa1Q6GSS7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hist2h2aa1Q6GSS7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hist2h2aa1Q6GSS7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hist2h2aa1Q6GSS7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hist2h2aa1Q6GSS7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hist2h2aa1Q6GSS7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hist2h2aa1Q6GSS7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hist2h2aa1Q6GSS7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hist2h2aa1Q6GSS7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hist2h2aa1Q6GSS7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hist2h2aa1Q6GSS7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hist2h2aa1Q6GSS7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hist2h2aa1Q6GSS7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hist2h2aa1Q6GSS7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hist2h2aa1Q6GSS7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hist2h2aa1Q6GSS7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hist2h2aa1Q6GSS7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hist2h2aa1Q6GSS7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hist2h2aa1Q6GSS7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hist2h2aa1Q6GSS7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hist2h2aa1Q6GSS7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Hist2h2aa1Q6GSS7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hist2h2aa1Q6GSS7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hist2h2aa1Q6GSS7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hist2h2aa1Q6GSS7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Hist2h2aa1Q6GSS7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hist2h2aa1Q6GSS7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hist2h2aa1Q6GSS7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hist2h2aa1Q6GSS7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hist2h2aa1Q6GSS7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Hist2h2aa1Q6GSS7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hist2h2aa1Q6GSS7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hist2h2aa1Q6GSS7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hist2h2aa1Q6GSS7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hist2h2aa1Q6GSS7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hist2h2aa1Q6GSS7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hist2h2aa1Q6GSS7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hist2h2aa1Q6GSS7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hist2h2aa1Q6GSS7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hist2h2aa1Q6GSS7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hist2h2aa1Q6GSS7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hist2h2aa1Q6GSS7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hist2h2aa1Q6GSS7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hist2h2aa1Q6GSS7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Hist2h2aa1Q6GSS7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hist2h2aa1Q6GSS7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms