Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB0

Lrrcc1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrcc1Q69ZB0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lrrcc1Q69ZB0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lrrcc1Q69ZB0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Lrrcc1Q69ZB0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Lrrcc1Q69ZB0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Lrrcc1Q69ZB0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Lrrcc1Q69ZB0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Lrrcc1Q69ZB0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lrrcc1Q69ZB0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lrrcc1Q69ZB0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Lrrcc1Q69ZB0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Lrrcc1Q69ZB0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Lrrcc1Q69ZB0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Lrrcc1Q69ZB0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Lrrcc1Q69ZB0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Lrrcc1Q69ZB0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Lrrcc1Q69ZB0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Lrrcc1Q69ZB0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Lrrcc1Q69ZB0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lrrcc1Q69ZB0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lrrcc1Q69ZB0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lrrcc1Q69ZB0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Lrrcc1Q69ZB0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Lrrcc1Q69ZB0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lrrcc1Q69ZB0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lrrcc1Q69ZB0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lrrcc1Q69ZB0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Lrrcc1Q69ZB0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Lrrcc1Q69ZB0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Lrrcc1Q69ZB0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Lrrcc1Q69ZB0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lrrcc1Q69ZB0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lrrcc1Q69ZB0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lrrcc1Q69ZB0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lrrcc1Q69ZB0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lrrcc1Q69ZB0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lrrcc1Q69ZB0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lrrcc1Q69ZB0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Lrrcc1Q69ZB0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lrrcc1Q69ZB0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Lrrcc1Q69ZB0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Lrrcc1Q69ZB0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Lrrcc1Q69ZB0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Lrrcc1Q69ZB0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Lrrcc1Q69ZB0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Lrrcc1Q69ZB0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lrrcc1Q69ZB0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lrrcc1Q69ZB0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lrrcc1Q69ZB0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lrrcc1Q69ZB0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lrrcc1Q69ZB0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Lrrcc1Q69ZB0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Lrrcc1Q69ZB0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Lrrcc1Q69ZB0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Lrrcc1Q69ZB0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Lrrcc1Q69ZB0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Lrrcc1Q69ZB0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Lrrcc1Q69ZB0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Lrrcc1Q69ZB0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Lrrcc1Q69ZB0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Lrrcc1Q69ZB0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Lrrcc1Q69ZB0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Lrrcc1Q69ZB0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Lrrcc1Q69ZB0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Lrrcc1Q69ZB0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Lrrcc1Q69ZB0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Lrrcc1Q69ZB0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Lrrcc1Q69ZB0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Lrrcc1Q69ZB0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Lrrcc1Q69ZB0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Lrrcc1Q69ZB0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Lrrcc1Q69ZB0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Lrrcc1Q69ZB0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Lrrcc1Q69ZB0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Lrrcc1Q69ZB0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Lrrcc1Q69ZB0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Lrrcc1Q69ZB0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Lrrcc1Q69ZB0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Lrrcc1Q69ZB0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Lrrcc1Q69ZB0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Lrrcc1Q69ZB0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Lrrcc1Q69ZB0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Lrrcc1Q69ZB0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Lrrcc1Q69ZB0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Lrrcc1Q69ZB0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Lrrcc1Q69ZB0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Lrrcc1Q69ZB0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Lrrcc1Q69ZB0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lrrcc1Q69ZB0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lrrcc1Q69ZB0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lrrcc1Q69ZB0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Lrrcc1Q69ZB0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Lrrcc1Q69ZB0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Lrrcc1Q69ZB0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lrrcc1Q69ZB0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lrrcc1Q69ZB0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lrrcc1Q69ZB0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lrrcc1Q69ZB0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lrrcc1Q69ZB0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lrrcc1Q69ZB0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms