Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pkp4Q68FH0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pkp4Q68FH0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pkp4Q68FH0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pkp4Q68FH0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pkp4Q68FH0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pkp4Q68FH0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pkp4Q68FH0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pkp4Q68FH0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pkp4Q68FH0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pkp4Q68FH0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pkp4Q68FH0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pkp4Q68FH0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pkp4Q68FH0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pkp4Q68FH0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pkp4Q68FH0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pkp4Q68FH0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pkp4Q68FH0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pkp4Q68FH0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pkp4Q68FH0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pkp4Q68FH0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pkp4Q68FH0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Pkp4Q68FH0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pkp4Q68FH0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pkp4Q68FH0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pkp4Q68FH0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pkp4Q68FH0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pkp4Q68FH0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Pkp4Q68FH0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pkp4Q68FH0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pkp4Q68FH0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pkp4Q68FH0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pkp4Q68FH0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pkp4Q68FH0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pkp4Q68FH0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pkp4Q68FH0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pkp4Q68FH0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pkp4Q68FH0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pkp4Q68FH0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pkp4Q68FH0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pkp4Q68FH0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pkp4Q68FH0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pkp4Q68FH0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pkp4Q68FH0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pkp4Q68FH0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pkp4Q68FH0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pkp4Q68FH0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pkp4Q68FH0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pkp4Q68FH0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pkp4Q68FH0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pkp4Q68FH0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pkp4Q68FH0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pkp4Q68FH0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pkp4Q68FH0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pkp4Q68FH0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pkp4Q68FH0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pkp4Q68FH0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pkp4Q68FH0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pkp4Q68FH0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Pkp4Q68FH0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pkp4Q68FH0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Pkp4Q68FH0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Pkp4Q68FH0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pkp4Q68FH0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pkp4Q68FH0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pkp4Q68FH0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pkp4Q68FH0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pkp4Q68FH0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pkp4Q68FH0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Pkp4Q68FH0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pkp4Q68FH0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pkp4Q68FH0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pkp4Q68FH0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pkp4Q68FH0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pkp4Q68FH0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pkp4Q68FH0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pkp4Q68FH0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Pkp4Q68FH0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pkp4Q68FH0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pkp4Q68FH0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pkp4Q68FH0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pkp4Q68FH0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pkp4Q68FH0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pkp4Q68FH0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pkp4Q68FH0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pkp4Q68FH0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pkp4Q68FH0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pkp4Q68FH0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pkp4Q68FH0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pkp4Q68FH0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pkp4Q68FH0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pkp4Q68FH0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pkp4Q68FH0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pkp4Q68FH0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pkp4Q68FH0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pkp4Q68FH0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pkp4Q68FH0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pkp4Q68FH0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pkp4Q68FH0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pkp4Q68FH0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms