Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Atg9aQ68FE2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Atg9aQ68FE2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Atg9aQ68FE2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Atg9aQ68FE2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Atg9aQ68FE2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Atg9aQ68FE2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Atg9aQ68FE2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Atg9aQ68FE2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Atg9aQ68FE2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Atg9aQ68FE2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Atg9aQ68FE2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Atg9aQ68FE2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Atg9aQ68FE2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Atg9aQ68FE2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Atg9aQ68FE2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Atg9aQ68FE2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Atg9aQ68FE2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Atg9aQ68FE2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Atg9aQ68FE2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Atg9aQ68FE2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Atg9aQ68FE2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Atg9aQ68FE2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Atg9aQ68FE2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Atg9aQ68FE2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Atg9aQ68FE2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Atg9aQ68FE2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Atg9aQ68FE2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Atg9aQ68FE2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Atg9aQ68FE2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Atg9aQ68FE2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Atg9aQ68FE2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Atg9aQ68FE2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Atg9aQ68FE2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Atg9aQ68FE2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Atg9aQ68FE2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Atg9aQ68FE2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Atg9aQ68FE2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Atg9aQ68FE2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Atg9aQ68FE2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Atg9aQ68FE2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Atg9aQ68FE2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Atg9aQ68FE2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Atg9aQ68FE2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Atg9aQ68FE2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Atg9aQ68FE2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Atg9aQ68FE2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Atg9aQ68FE2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Atg9aQ68FE2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Atg9aQ68FE2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Atg9aQ68FE2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Atg9aQ68FE2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Atg9aQ68FE2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Atg9aQ68FE2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Atg9aQ68FE2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Atg9aQ68FE2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Atg9aQ68FE2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Atg9aQ68FE2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Atg9aQ68FE2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Atg9aQ68FE2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Atg9aQ68FE2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Atg9aQ68FE2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Atg9aQ68FE2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Atg9aQ68FE2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Atg9aQ68FE2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Atg9aQ68FE2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Atg9aQ68FE2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Atg9aQ68FE2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Atg9aQ68FE2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Atg9aQ68FE2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Atg9aQ68FE2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Atg9aQ68FE2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Atg9aQ68FE2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Atg9aQ68FE2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Atg9aQ68FE2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Atg9aQ68FE2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Atg9aQ68FE2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Atg9aQ68FE2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Atg9aQ68FE2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Atg9aQ68FE2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Atg9aQ68FE2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Atg9aQ68FE2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Atg9aQ68FE2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Atg9aQ68FE2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Atg9aQ68FE2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Atg9aQ68FE2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Atg9aQ68FE2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Atg9aQ68FE2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Atg9aQ68FE2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Atg9aQ68FE2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Atg9aQ68FE2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Atg9aQ68FE2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Atg9aQ68FE2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Atg9aQ68FE2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Atg9aQ68FE2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Atg9aQ68FE2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Atg9aQ68FE2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Atg9aQ68FE2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Atg9aQ68FE2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Atg9aQ68FE2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
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