Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PtprdQ64487 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PtprdQ64487 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PtprdQ64487 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PtprdQ64487 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PtprdQ64487 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PtprdQ64487 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PtprdQ64487 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PtprdQ64487 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PtprdQ64487 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PtprdQ64487 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PtprdQ64487 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PtprdQ64487 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PtprdQ64487 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PtprdQ64487 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PtprdQ64487 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PtprdQ64487 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PtprdQ64487 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PtprdQ64487 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PtprdQ64487 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PtprdQ64487 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PtprdQ64487 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PtprdQ64487 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PtprdQ64487 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PtprdQ64487 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PtprdQ64487 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PtprdQ64487 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PtprdQ64487 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PtprdQ64487 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PtprdQ64487 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PtprdQ64487 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PtprdQ64487 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PtprdQ64487 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PtprdQ64487 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PtprdQ64487 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PtprdQ64487 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PtprdQ64487 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PtprdQ64487 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PtprdQ64487 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PtprdQ64487 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PtprdQ64487 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PtprdQ64487 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PtprdQ64487 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PtprdQ64487 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PtprdQ64487 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PtprdQ64487 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PtprdQ64487 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PtprdQ64487 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PtprdQ64487 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PtprdQ64487 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PtprdQ64487 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PtprdQ64487 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PtprdQ64487 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PtprdQ64487 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PtprdQ64487 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PtprdQ64487 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PtprdQ64487 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PtprdQ64487 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PtprdQ64487 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PtprdQ64487 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PtprdQ64487 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PtprdQ64487 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PtprdQ64487 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PtprdQ64487 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PtprdQ64487 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PtprdQ64487 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PtprdQ64487 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PtprdQ64487 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PtprdQ64487 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PtprdQ64487 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PtprdQ64487 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PtprdQ64487 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PtprdQ64487 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PtprdQ64487 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PtprdQ64487 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PtprdQ64487 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PtprdQ64487 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PtprdQ64487 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PtprdQ64487 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PtprdQ64487 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtprdQ64487 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtprdQ64487 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtprdQ64487 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PtprdQ64487 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PtprdQ64487 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PtprdQ64487 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PtprdQ64487 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PtprdQ64487 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
PtprdQ64487 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PtprdQ64487 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PtprdQ64487 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PtprdQ64487 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PtprdQ64487 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PtprdQ64487 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PtprdQ64487 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PtprdQ64487 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PtprdQ64487 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PtprdQ64487 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PtprdQ64487 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PtprdQ64487 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
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