Protein–RNA interactions for Protein: Q64448

Gja3, Gap junction alpha-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja3Q64448 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Gja3Q64448 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Gja3Q64448 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Gja3Q64448 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Gja3Q64448 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Gja3Q64448 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Gja3Q64448 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Gja3Q64448 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Gja3Q64448 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Gja3Q64448 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Gja3Q64448 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Gja3Q64448 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Gja3Q64448 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Gja3Q64448 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Gja3Q64448 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Gja3Q64448 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Gja3Q64448 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Gja3Q64448 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Gja3Q64448 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Gja3Q64448 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Gja3Q64448 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Gja3Q64448 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Gja3Q64448 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Gja3Q64448 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Gja3Q64448 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Gja3Q64448 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Gja3Q64448 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Gja3Q64448 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Gja3Q64448 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Gja3Q64448 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Gja3Q64448 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Gja3Q64448 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Gja3Q64448 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Gja3Q64448 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Gja3Q64448 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Gja3Q64448 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Gja3Q64448 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Gja3Q64448 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Gja3Q64448 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
Gja3Q64448 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Gja3Q64448 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Gja3Q64448 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Gja3Q64448 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Gja3Q64448 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Gja3Q64448 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Gja3Q64448 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Gja3Q64448 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Gja3Q64448 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Gja3Q64448 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Gja3Q64448 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Gja3Q64448 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Gja3Q64448 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Gja3Q64448 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Gja3Q64448 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Gja3Q64448 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Gja3Q64448 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Gja3Q64448 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Gja3Q64448 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Gja3Q64448 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Gja3Q64448 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gja3Q64448 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Gja3Q64448 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Gja3Q64448 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Gja3Q64448 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Gja3Q64448 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Gja3Q64448 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Gja3Q64448 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Gja3Q64448 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Gja3Q64448 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Gja3Q64448 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Gja3Q64448 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Gja3Q64448 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gja3Q64448 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gja3Q64448 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gja3Q64448 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gja3Q64448 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gja3Q64448 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Gja3Q64448 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Gja3Q64448 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Gja3Q64448 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Gja3Q64448 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Gja3Q64448 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Gja3Q64448 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gja3Q64448 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Gja3Q64448 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Gja3Q64448 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Gja3Q64448 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Gja3Q64448 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Gja3Q64448 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Gja3Q64448 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Gja3Q64448 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gja3Q64448 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gja3Q64448 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Gja3Q64448 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Gja3Q64448 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Gja3Q64448 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Gja3Q64448 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Gja3Q64448 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Gja3Q64448 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Gja3Q64448 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms