Protein–RNA interactions for Protein: Q64345

Ifit3, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit3Q64345 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ifit3Q64345 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ifit3Q64345 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ifit3Q64345 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ifit3Q64345 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ifit3Q64345 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ifit3Q64345 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ifit3Q64345 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ifit3Q64345 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ifit3Q64345 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ifit3Q64345 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ifit3Q64345 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ifit3Q64345 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ifit3Q64345 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ifit3Q64345 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ifit3Q64345 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ifit3Q64345 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ifit3Q64345 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ifit3Q64345 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ifit3Q64345 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ifit3Q64345 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ifit3Q64345 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ifit3Q64345 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ifit3Q64345 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ifit3Q64345 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ifit3Q64345 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ifit3Q64345 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ifit3Q64345 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ifit3Q64345 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ifit3Q64345 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ifit3Q64345 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ifit3Q64345 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ifit3Q64345 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ifit3Q64345 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ifit3Q64345 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ifit3Q64345 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ifit3Q64345 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ifit3Q64345 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ifit3Q64345 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ifit3Q64345 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ifit3Q64345 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ifit3Q64345 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ifit3Q64345 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ifit3Q64345 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ifit3Q64345 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ifit3Q64345 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ifit3Q64345 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ifit3Q64345 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ifit3Q64345 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ifit3Q64345 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ifit3Q64345 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ifit3Q64345 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ifit3Q64345 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ifit3Q64345 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ifit3Q64345 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ifit3Q64345 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ifit3Q64345 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ifit3Q64345 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ifit3Q64345 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ifit3Q64345 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ifit3Q64345 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ifit3Q64345 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ifit3Q64345 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ifit3Q64345 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ifit3Q64345 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ifit3Q64345 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ifit3Q64345 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ifit3Q64345 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ifit3Q64345 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ifit3Q64345 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ifit3Q64345 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ifit3Q64345 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ifit3Q64345 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ifit3Q64345 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ifit3Q64345 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ifit3Q64345 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ifit3Q64345 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ifit3Q64345 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ifit3Q64345 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ifit3Q64345 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ifit3Q64345 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ifit3Q64345 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ifit3Q64345 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ifit3Q64345 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ifit3Q64345 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ifit3Q64345 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ifit3Q64345 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ifit3Q64345 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ifit3Q64345 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ifit3Q64345 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ifit3Q64345 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ifit3Q64345 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ifit3Q64345 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ifit3Q64345 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ifit3Q64345 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ifit3Q64345 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ifit3Q64345 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ifit3Q64345 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ifit3Q64345 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ifit3Q64345 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms