Protein–RNA interactions for Protein: Q64310

Surf4, Surfeit locus protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf4Q64310 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Surf4Q64310 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Surf4Q64310 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Surf4Q64310 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Surf4Q64310 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Surf4Q64310 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Surf4Q64310 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Surf4Q64310 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Surf4Q64310 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Surf4Q64310 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Surf4Q64310 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Surf4Q64310 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Surf4Q64310 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Surf4Q64310 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Surf4Q64310 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Surf4Q64310 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Surf4Q64310 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Surf4Q64310 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Surf4Q64310 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Surf4Q64310 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Surf4Q64310 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Surf4Q64310 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Surf4Q64310 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Surf4Q64310 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Surf4Q64310 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Surf4Q64310 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Surf4Q64310 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Surf4Q64310 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Surf4Q64310 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Surf4Q64310 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Surf4Q64310 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Surf4Q64310 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Surf4Q64310 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Surf4Q64310 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Surf4Q64310 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Surf4Q64310 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Surf4Q64310 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Surf4Q64310 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Surf4Q64310 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Surf4Q64310 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Surf4Q64310 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Surf4Q64310 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Surf4Q64310 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Surf4Q64310 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Surf4Q64310 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Surf4Q64310 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Surf4Q64310 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Surf4Q64310 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Surf4Q64310 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Surf4Q64310 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Surf4Q64310 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Surf4Q64310 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Surf4Q64310 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Surf4Q64310 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Surf4Q64310 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Surf4Q64310 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Surf4Q64310 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Surf4Q64310 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Surf4Q64310 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Surf4Q64310 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Surf4Q64310 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Surf4Q64310 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Surf4Q64310 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Surf4Q64310 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Surf4Q64310 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Surf4Q64310 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Surf4Q64310 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Surf4Q64310 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Surf4Q64310 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Surf4Q64310 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Surf4Q64310 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Surf4Q64310 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Surf4Q64310 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Surf4Q64310 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Surf4Q64310 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Surf4Q64310 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Surf4Q64310 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Surf4Q64310 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Surf4Q64310 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Surf4Q64310 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Surf4Q64310 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Surf4Q64310 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Surf4Q64310 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Surf4Q64310 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Surf4Q64310 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Surf4Q64310 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Surf4Q64310 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Surf4Q64310 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Surf4Q64310 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Surf4Q64310 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Surf4Q64310 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Surf4Q64310 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Surf4Q64310 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Surf4Q64310 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Surf4Q64310 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Surf4Q64310 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Surf4Q64310 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Surf4Q64310 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Surf4Q64310 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Surf4Q64310 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms