Protein–RNA interactions for Protein: Q64264

Htr1a, 5-hydroxytryptamine receptor 1A, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr1aQ64264 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Htr1aQ64264 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Htr1aQ64264 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Htr1aQ64264 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Htr1aQ64264 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Htr1aQ64264 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Htr1aQ64264 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Htr1aQ64264 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Htr1aQ64264 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Htr1aQ64264 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Htr1aQ64264 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Htr1aQ64264 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Htr1aQ64264 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Htr1aQ64264 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Htr1aQ64264 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Htr1aQ64264 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Htr1aQ64264 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Htr1aQ64264 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Htr1aQ64264 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Htr1aQ64264 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Htr1aQ64264 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Htr1aQ64264 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Htr1aQ64264 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Htr1aQ64264 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Htr1aQ64264 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Htr1aQ64264 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Htr1aQ64264 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Htr1aQ64264 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Htr1aQ64264 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Htr1aQ64264 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Htr1aQ64264 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Htr1aQ64264 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Htr1aQ64264 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Htr1aQ64264 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Htr1aQ64264 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Htr1aQ64264 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Htr1aQ64264 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Htr1aQ64264 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Htr1aQ64264 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Htr1aQ64264 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Htr1aQ64264 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Htr1aQ64264 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Htr1aQ64264 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Htr1aQ64264 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Htr1aQ64264 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Htr1aQ64264 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Htr1aQ64264 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Htr1aQ64264 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Htr1aQ64264 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Htr1aQ64264 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Htr1aQ64264 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Htr1aQ64264 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Htr1aQ64264 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Htr1aQ64264 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Htr1aQ64264 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Htr1aQ64264 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Htr1aQ64264 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Htr1aQ64264 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Htr1aQ64264 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Htr1aQ64264 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Htr1aQ64264 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Htr1aQ64264 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Htr1aQ64264 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Htr1aQ64264 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Htr1aQ64264 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Htr1aQ64264 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Htr1aQ64264 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Htr1aQ64264 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Htr1aQ64264 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Htr1aQ64264 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Htr1aQ64264 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Htr1aQ64264 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Htr1aQ64264 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Htr1aQ64264 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Htr1aQ64264 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Htr1aQ64264 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Htr1aQ64264 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Htr1aQ64264 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Htr1aQ64264 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Htr1aQ64264 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Htr1aQ64264 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Htr1aQ64264 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Htr1aQ64264 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Htr1aQ64264 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Htr1aQ64264 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Htr1aQ64264 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Htr1aQ64264 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Htr1aQ64264 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Htr1aQ64264 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Htr1aQ64264 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Htr1aQ64264 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Htr1aQ64264 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Htr1aQ64264 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Htr1aQ64264 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Htr1aQ64264 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Htr1aQ64264 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Htr1aQ64264 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Htr1aQ64264 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Htr1aQ64264 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Htr1aQ64264 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms