Protein–RNA interactions for Protein: Q63871

Polr2k, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2kQ63871 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Polr2kQ63871 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Polr2kQ63871 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Polr2kQ63871 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Polr2kQ63871 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Polr2kQ63871 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Polr2kQ63871 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Polr2kQ63871 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Polr2kQ63871 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Polr2kQ63871 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Polr2kQ63871 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Polr2kQ63871 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Polr2kQ63871 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Polr2kQ63871 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Polr2kQ63871 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Polr2kQ63871 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Polr2kQ63871 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Polr2kQ63871 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Polr2kQ63871 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr2kQ63871 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr2kQ63871 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr2kQ63871 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr2kQ63871 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr2kQ63871 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr2kQ63871 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr2kQ63871 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Polr2kQ63871 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Polr2kQ63871 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Polr2kQ63871 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Polr2kQ63871 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Polr2kQ63871 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Polr2kQ63871 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr2kQ63871 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr2kQ63871 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr2kQ63871 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr2kQ63871 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr2kQ63871 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr2kQ63871 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr2kQ63871 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Polr2kQ63871 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Polr2kQ63871 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Polr2kQ63871 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Polr2kQ63871 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Polr2kQ63871 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Polr2kQ63871 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Polr2kQ63871 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Polr2kQ63871 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Polr2kQ63871 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Polr2kQ63871 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Polr2kQ63871 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Polr2kQ63871 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Polr2kQ63871 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Polr2kQ63871 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Polr2kQ63871 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Polr2kQ63871 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Polr2kQ63871 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Polr2kQ63871 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Polr2kQ63871 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Polr2kQ63871 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Polr2kQ63871 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Polr2kQ63871 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Polr2kQ63871 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Polr2kQ63871 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Polr2kQ63871 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Polr2kQ63871 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Polr2kQ63871 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Polr2kQ63871 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Polr2kQ63871 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Polr2kQ63871 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Polr2kQ63871 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Polr2kQ63871 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Polr2kQ63871 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Polr2kQ63871 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Polr2kQ63871 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Polr2kQ63871 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Polr2kQ63871 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Polr2kQ63871 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Polr2kQ63871 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Polr2kQ63871 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Polr2kQ63871 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Polr2kQ63871 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Polr2kQ63871 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Polr2kQ63871 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Polr2kQ63871 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Polr2kQ63871 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Polr2kQ63871 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Polr2kQ63871 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Polr2kQ63871 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Polr2kQ63871 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Polr2kQ63871 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr2kQ63871 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr2kQ63871 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr2kQ63871 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr2kQ63871 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr2kQ63871 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr2kQ63871 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr2kQ63871 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr2kQ63871 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr2kQ63871 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr2kQ63871 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms