Protein–RNA interactions for Protein: Q62520

Zic2, Zinc finger protein ZIC 2, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic2Q62520 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zic2Q62520 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zic2Q62520 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zic2Q62520 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zic2Q62520 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zic2Q62520 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zic2Q62520 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zic2Q62520 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zic2Q62520 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zic2Q62520 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zic2Q62520 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zic2Q62520 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zic2Q62520 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zic2Q62520 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zic2Q62520 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zic2Q62520 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zic2Q62520 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zic2Q62520 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zic2Q62520 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zic2Q62520 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zic2Q62520 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zic2Q62520 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zic2Q62520 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zic2Q62520 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zic2Q62520 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zic2Q62520 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zic2Q62520 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zic2Q62520 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zic2Q62520 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zic2Q62520 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zic2Q62520 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zic2Q62520 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zic2Q62520 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zic2Q62520 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Zic2Q62520 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zic2Q62520 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Zic2Q62520 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zic2Q62520 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zic2Q62520 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zic2Q62520 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zic2Q62520 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zic2Q62520 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zic2Q62520 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zic2Q62520 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zic2Q62520 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zic2Q62520 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zic2Q62520 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zic2Q62520 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Zic2Q62520 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zic2Q62520 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zic2Q62520 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zic2Q62520 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Zic2Q62520 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Zic2Q62520 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Zic2Q62520 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zic2Q62520 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zic2Q62520 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zic2Q62520 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zic2Q62520 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zic2Q62520 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zic2Q62520 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zic2Q62520 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zic2Q62520 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zic2Q62520 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zic2Q62520 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zic2Q62520 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zic2Q62520 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zic2Q62520 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zic2Q62520 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zic2Q62520 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zic2Q62520 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zic2Q62520 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zic2Q62520 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zic2Q62520 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zic2Q62520 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zic2Q62520 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zic2Q62520 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zic2Q62520 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zic2Q62520 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zic2Q62520 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zic2Q62520 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Zic2Q62520 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zic2Q62520 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zic2Q62520 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zic2Q62520 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zic2Q62520 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zic2Q62520 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zic2Q62520 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zic2Q62520 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zic2Q62520 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zic2Q62520 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zic2Q62520 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zic2Q62520 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zic2Q62520 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Zic2Q62520 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zic2Q62520 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zic2Q62520 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zic2Q62520 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zic2Q62520 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zic2Q62520 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms