Protein–RNA interactions for Protein: Q62232

Six2, Homeobox protein SIX2, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six2Q62232 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Six2Q62232 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Six2Q62232 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Six2Q62232 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Six2Q62232 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Six2Q62232 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Six2Q62232 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Six2Q62232 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Six2Q62232 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Six2Q62232 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Six2Q62232 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Six2Q62232 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Six2Q62232 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Six2Q62232 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Six2Q62232 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Six2Q62232 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Six2Q62232 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Six2Q62232 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Six2Q62232 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Six2Q62232 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Six2Q62232 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Six2Q62232 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Six2Q62232 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Six2Q62232 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Six2Q62232 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Six2Q62232 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Six2Q62232 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Six2Q62232 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Six2Q62232 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Six2Q62232 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Six2Q62232 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Six2Q62232 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Six2Q62232 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Six2Q62232 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Six2Q62232 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Six2Q62232 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Six2Q62232 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Six2Q62232 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Six2Q62232 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Six2Q62232 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Six2Q62232 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Six2Q62232 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Six2Q62232 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Six2Q62232 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Six2Q62232 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Six2Q62232 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Six2Q62232 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Six2Q62232 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Six2Q62232 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Six2Q62232 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Six2Q62232 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Six2Q62232 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Six2Q62232 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Six2Q62232 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Six2Q62232 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Six2Q62232 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Six2Q62232 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Six2Q62232 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Six2Q62232 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Six2Q62232 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Six2Q62232 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Six2Q62232 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Six2Q62232 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Six2Q62232 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Six2Q62232 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Six2Q62232 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Six2Q62232 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Six2Q62232 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Six2Q62232 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Six2Q62232 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Six2Q62232 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Six2Q62232 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Six2Q62232 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Six2Q62232 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Six2Q62232 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Six2Q62232 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Six2Q62232 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Six2Q62232 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Six2Q62232 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Six2Q62232 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Six2Q62232 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Six2Q62232 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Six2Q62232 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Six2Q62232 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Six2Q62232 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Six2Q62232 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Six2Q62232 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Six2Q62232 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Six2Q62232 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Six2Q62232 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Six2Q62232 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Six2Q62232 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Six2Q62232 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Six2Q62232 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Six2Q62232 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Six2Q62232 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Six2Q62232 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Six2Q62232 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Six2Q62232 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Six2Q62232 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms