Protein–RNA interactions for Protein: Q62217

Sema5a, Semaphorin-5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema5aQ62217 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sema5aQ62217 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sema5aQ62217 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sema5aQ62217 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sema5aQ62217 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sema5aQ62217 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sema5aQ62217 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sema5aQ62217 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sema5aQ62217 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sema5aQ62217 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sema5aQ62217 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sema5aQ62217 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sema5aQ62217 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sema5aQ62217 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Sema5aQ62217 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sema5aQ62217 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Sema5aQ62217 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sema5aQ62217 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sema5aQ62217 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sema5aQ62217 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sema5aQ62217 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sema5aQ62217 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sema5aQ62217 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Sema5aQ62217 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sema5aQ62217 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sema5aQ62217 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sema5aQ62217 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sema5aQ62217 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sema5aQ62217 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sema5aQ62217 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sema5aQ62217 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sema5aQ62217 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Sema5aQ62217 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Sema5aQ62217 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sema5aQ62217 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sema5aQ62217 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sema5aQ62217 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sema5aQ62217 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sema5aQ62217 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sema5aQ62217 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sema5aQ62217 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Sema5aQ62217 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sema5aQ62217 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sema5aQ62217 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sema5aQ62217 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sema5aQ62217 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sema5aQ62217 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sema5aQ62217 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sema5aQ62217 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sema5aQ62217 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sema5aQ62217 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sema5aQ62217 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sema5aQ62217 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sema5aQ62217 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Sema5aQ62217 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Sema5aQ62217 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sema5aQ62217 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sema5aQ62217 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sema5aQ62217 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sema5aQ62217 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sema5aQ62217 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sema5aQ62217 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sema5aQ62217 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sema5aQ62217 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sema5aQ62217 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sema5aQ62217 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Sema5aQ62217 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sema5aQ62217 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sema5aQ62217 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sema5aQ62217 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sema5aQ62217 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sema5aQ62217 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sema5aQ62217 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sema5aQ62217 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sema5aQ62217 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sema5aQ62217 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sema5aQ62217 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sema5aQ62217 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sema5aQ62217 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sema5aQ62217 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sema5aQ62217 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Sema5aQ62217 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sema5aQ62217 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sema5aQ62217 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sema5aQ62217 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sema5aQ62217 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sema5aQ62217 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sema5aQ62217 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sema5aQ62217 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sema5aQ62217 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Sema5aQ62217 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sema5aQ62217 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sema5aQ62217 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sema5aQ62217 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sema5aQ62217 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sema5aQ62217 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sema5aQ62217 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sema5aQ62217 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sema5aQ62217 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sema5aQ62217 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms