Protein–RNA interactions for Protein: Q62203

Sf3a2, Splicing factor 3A subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a2Q62203 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sf3a2Q62203 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sf3a2Q62203 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sf3a2Q62203 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sf3a2Q62203 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sf3a2Q62203 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sf3a2Q62203 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sf3a2Q62203 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sf3a2Q62203 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sf3a2Q62203 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sf3a2Q62203 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sf3a2Q62203 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sf3a2Q62203 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sf3a2Q62203 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sf3a2Q62203 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sf3a2Q62203 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sf3a2Q62203 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sf3a2Q62203 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sf3a2Q62203 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sf3a2Q62203 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sf3a2Q62203 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sf3a2Q62203 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sf3a2Q62203 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sf3a2Q62203 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sf3a2Q62203 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sf3a2Q62203 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sf3a2Q62203 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sf3a2Q62203 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sf3a2Q62203 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Sf3a2Q62203 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sf3a2Q62203 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sf3a2Q62203 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sf3a2Q62203 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sf3a2Q62203 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sf3a2Q62203 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sf3a2Q62203 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sf3a2Q62203 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sf3a2Q62203 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sf3a2Q62203 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sf3a2Q62203 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sf3a2Q62203 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sf3a2Q62203 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sf3a2Q62203 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Sf3a2Q62203 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sf3a2Q62203 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sf3a2Q62203 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sf3a2Q62203 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sf3a2Q62203 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sf3a2Q62203 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sf3a2Q62203 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sf3a2Q62203 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Sf3a2Q62203 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sf3a2Q62203 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sf3a2Q62203 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sf3a2Q62203 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sf3a2Q62203 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sf3a2Q62203 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sf3a2Q62203 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sf3a2Q62203 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sf3a2Q62203 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sf3a2Q62203 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sf3a2Q62203 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sf3a2Q62203 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sf3a2Q62203 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sf3a2Q62203 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sf3a2Q62203 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sf3a2Q62203 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sf3a2Q62203 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sf3a2Q62203 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sf3a2Q62203 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sf3a2Q62203 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sf3a2Q62203 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sf3a2Q62203 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sf3a2Q62203 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sf3a2Q62203 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sf3a2Q62203 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sf3a2Q62203 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sf3a2Q62203 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sf3a2Q62203 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sf3a2Q62203 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sf3a2Q62203 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sf3a2Q62203 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sf3a2Q62203 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sf3a2Q62203 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sf3a2Q62203 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sf3a2Q62203 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sf3a2Q62203 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sf3a2Q62203 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sf3a2Q62203 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sf3a2Q62203 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sf3a2Q62203 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sf3a2Q62203 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sf3a2Q62203 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sf3a2Q62203 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sf3a2Q62203 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sf3a2Q62203 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sf3a2Q62203 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sf3a2Q62203 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sf3a2Q62203 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sf3a2Q62203 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms