Protein–RNA interactions for Protein: Q62191

Trim21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim21Q62191 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim21Q62191 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim21Q62191 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim21Q62191 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim21Q62191 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim21Q62191 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim21Q62191 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim21Q62191 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Trim21Q62191 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim21Q62191 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim21Q62191 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim21Q62191 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim21Q62191 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim21Q62191 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim21Q62191 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim21Q62191 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim21Q62191 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim21Q62191 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim21Q62191 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim21Q62191 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim21Q62191 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim21Q62191 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim21Q62191 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim21Q62191 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim21Q62191 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trim21Q62191 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trim21Q62191 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim21Q62191 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim21Q62191 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim21Q62191 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim21Q62191 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim21Q62191 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim21Q62191 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim21Q62191 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim21Q62191 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim21Q62191 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim21Q62191 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim21Q62191 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim21Q62191 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim21Q62191 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim21Q62191 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim21Q62191 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim21Q62191 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim21Q62191 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim21Q62191 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim21Q62191 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim21Q62191 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim21Q62191 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim21Q62191 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim21Q62191 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim21Q62191 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim21Q62191 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim21Q62191 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim21Q62191 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim21Q62191 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim21Q62191 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim21Q62191 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim21Q62191 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim21Q62191 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim21Q62191 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim21Q62191 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim21Q62191 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim21Q62191 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim21Q62191 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim21Q62191 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim21Q62191 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim21Q62191 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim21Q62191 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim21Q62191 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim21Q62191 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim21Q62191 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim21Q62191 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim21Q62191 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim21Q62191 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim21Q62191 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim21Q62191 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim21Q62191 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim21Q62191 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim21Q62191 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim21Q62191 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim21Q62191 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim21Q62191 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim21Q62191 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim21Q62191 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim21Q62191 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim21Q62191 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Trim21Q62191 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trim21Q62191 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim21Q62191 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim21Q62191 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim21Q62191 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim21Q62191 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim21Q62191 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim21Q62191 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim21Q62191 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim21Q62191 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim21Q62191 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim21Q62191 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim21Q62191 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim21Q62191 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms