Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sin3bQ62141 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sin3bQ62141 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sin3bQ62141 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sin3bQ62141 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sin3bQ62141 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sin3bQ62141 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sin3bQ62141 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sin3bQ62141 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sin3bQ62141 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sin3bQ62141 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sin3bQ62141 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sin3bQ62141 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sin3bQ62141 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sin3bQ62141 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sin3bQ62141 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sin3bQ62141 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sin3bQ62141 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sin3bQ62141 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sin3bQ62141 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sin3bQ62141 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sin3bQ62141 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sin3bQ62141 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Sin3bQ62141 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sin3bQ62141 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sin3bQ62141 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sin3bQ62141 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sin3bQ62141 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sin3bQ62141 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sin3bQ62141 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sin3bQ62141 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sin3bQ62141 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sin3bQ62141 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sin3bQ62141 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Sin3bQ62141 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Sin3bQ62141 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sin3bQ62141 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sin3bQ62141 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sin3bQ62141 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sin3bQ62141 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sin3bQ62141 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sin3bQ62141 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sin3bQ62141 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sin3bQ62141 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Sin3bQ62141 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sin3bQ62141 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sin3bQ62141 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sin3bQ62141 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sin3bQ62141 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sin3bQ62141 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sin3bQ62141 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sin3bQ62141 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sin3bQ62141 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sin3bQ62141 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sin3bQ62141 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sin3bQ62141 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sin3bQ62141 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sin3bQ62141 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sin3bQ62141 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sin3bQ62141 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Sin3bQ62141 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Sin3bQ62141 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sin3bQ62141 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sin3bQ62141 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sin3bQ62141 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sin3bQ62141 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sin3bQ62141 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sin3bQ62141 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sin3bQ62141 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sin3bQ62141 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sin3bQ62141 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sin3bQ62141 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sin3bQ62141 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sin3bQ62141 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sin3bQ62141 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sin3bQ62141 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sin3bQ62141 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Sin3bQ62141 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Sin3bQ62141 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Sin3bQ62141 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sin3bQ62141 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sin3bQ62141 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sin3bQ62141 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sin3bQ62141 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sin3bQ62141 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sin3bQ62141 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sin3bQ62141 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sin3bQ62141 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sin3bQ62141 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sin3bQ62141 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Sin3bQ62141 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sin3bQ62141 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sin3bQ62141 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sin3bQ62141 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sin3bQ62141 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sin3bQ62141 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sin3bQ62141 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sin3bQ62141 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sin3bQ62141 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sin3bQ62141 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms