Protein–RNA interactions for Protein: Q62100

Prm3, Protamine-3, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prm3Q62100 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC22,49■■□□□ 1,19
Prm3Q62100 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,49■■□□□ 1,19
Prm3Q62100 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,48■■□□□ 1,19
Prm3Q62100 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,48■■□□□ 1,19
Prm3Q62100 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22,47■■□□□ 1,19
Prm3Q62100 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,47■■□□□ 1,19
Prm3Q62100 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,46■■□□□ 1,19
Prm3Q62100 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,46■■□□□ 1,19
Prm3Q62100 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,46■■□□□ 1,19
Prm3Q62100 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,45■■□□□ 1,19
Prm3Q62100 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,45■■□□□ 1,18
Prm3Q62100 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,45■■□□□ 1,18
Prm3Q62100 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,45■■□□□ 1,18
Prm3Q62100 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22,44■■□□□ 1,18
Prm3Q62100 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,44■■□□□ 1,18
Prm3Q62100 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,44■■□□□ 1,18
Prm3Q62100 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22,42■■□□□ 1,18
Prm3Q62100 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22,42■■□□□ 1,18
Prm3Q62100 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC22,42■■□□□ 1,18
Prm3Q62100 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,41■■□□□ 1,18
Prm3Q62100 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22,41■■□□□ 1,18
Prm3Q62100 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,41■■□□□ 1,18
Prm3Q62100 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,4■■□□□ 1,18
Prm3Q62100 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,4■■□□□ 1,18
Prm3Q62100 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22,4■■□□□ 1,18
Prm3Q62100 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22,4■■□□□ 1,18
Prm3Q62100 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,4■■□□□ 1,18
Prm3Q62100 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,39■■□□□ 1,18
Prm3Q62100 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22,39■■□□□ 1,18
Prm3Q62100 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,39■■□□□ 1,18
Prm3Q62100 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,39■■□□□ 1,18
Prm3Q62100 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,39■■□□□ 1,17
Prm3Q62100 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22,39■■□□□ 1,17
Prm3Q62100 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC22,39■■□□□ 1,17
Prm3Q62100 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC22,39■■□□□ 1,17
Prm3Q62100 Il4-204ENSMUST00000150568 605 ntTSL 1 (best) BASIC22,39■■□□□ 1,17
Prm3Q62100 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,39■■□□□ 1,17
Prm3Q62100 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22,39■■□□□ 1,17
Prm3Q62100 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,39■■□□□ 1,17
Prm3Q62100 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,39■■□□□ 1,17
Prm3Q62100 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22,38■■□□□ 1,17
Prm3Q62100 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,38■■□□□ 1,17
Prm3Q62100 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,37■■□□□ 1,17
Prm3Q62100 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22,37■■□□□ 1,17
Prm3Q62100 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22,37■■□□□ 1,17
Prm3Q62100 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,36■■□□□ 1,17
Prm3Q62100 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,36■■□□□ 1,17
Prm3Q62100 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22,36■■□□□ 1,17
Prm3Q62100 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,36■■□□□ 1,17
Prm3Q62100 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,36■■□□□ 1,17
Prm3Q62100 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC22,35■■□□□ 1,17
Prm3Q62100 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC22,35■■□□□ 1,17
Prm3Q62100 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22,35■■□□□ 1,17
Prm3Q62100 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22,35■■□□□ 1,17
Prm3Q62100 Gm45251-201ENSMUST00000209486 1465 ntBASIC22,35■■□□□ 1,17
Prm3Q62100 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22,35■■□□□ 1,17
Prm3Q62100 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC22,35■■□□□ 1,17
Prm3Q62100 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22,35■■□□□ 1,17
Prm3Q62100 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,35■■□□□ 1,17
Prm3Q62100 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22,33■■□□□ 1,17
Prm3Q62100 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,33■■□□□ 1,17
Prm3Q62100 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,33■■□□□ 1,16
Prm3Q62100 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22,33■■□□□ 1,16
Prm3Q62100 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,32■■□□□ 1,16
Prm3Q62100 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,32■■□□□ 1,16
Prm3Q62100 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,31■■□□□ 1,16
Prm3Q62100 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,31■■□□□ 1,16
Prm3Q62100 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,31■■□□□ 1,16
Prm3Q62100 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22,31■■□□□ 1,16
Prm3Q62100 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,3■■□□□ 1,16
Prm3Q62100 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,3■■□□□ 1,16
Prm3Q62100 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22,3■■□□□ 1,16
Prm3Q62100 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,3■■□□□ 1,16
Prm3Q62100 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,3■■□□□ 1,16
Prm3Q62100 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,3■■□□□ 1,16
Prm3Q62100 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,3■■□□□ 1,16
Prm3Q62100 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,29■■□□□ 1,16
Prm3Q62100 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC22,28■■□□□ 1,16
Prm3Q62100 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,27■■□□□ 1,16
Prm3Q62100 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,27■■□□□ 1,16
Prm3Q62100 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22,27■■□□□ 1,15
Prm3Q62100 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22,26■■□□□ 1,15
Prm3Q62100 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,26■■□□□ 1,15
Prm3Q62100 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,26■■□□□ 1,15
Prm3Q62100 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC22,26■■□□□ 1,15
Prm3Q62100 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,25■■□□□ 1,15
Prm3Q62100 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22,25■■□□□ 1,15
Prm3Q62100 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,25■■□□□ 1,15
Prm3Q62100 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,25■■□□□ 1,15
Prm3Q62100 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22,25■■□□□ 1,15
Prm3Q62100 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22,24■■□□□ 1,15
Prm3Q62100 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,24■■□□□ 1,15
Prm3Q62100 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22,23■■□□□ 1,15
Prm3Q62100 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,23■■□□□ 1,15
Prm3Q62100 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,23■■□□□ 1,15
Prm3Q62100 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,23■■□□□ 1,15
Prm3Q62100 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22,23■■□□□ 1,15
Prm3Q62100 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,22■■□□□ 1,15
Prm3Q62100 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,22■■□□□ 1,15
Prm3Q62100 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC22,22■■□□□ 1,15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21,2 ms