Protein–RNA interactions for Protein: Q61999

Odf1, Outer dense fiber protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf1Q61999 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Odf1Q61999 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Odf1Q61999 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Odf1Q61999 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Odf1Q61999 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Odf1Q61999 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Odf1Q61999 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Odf1Q61999 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Odf1Q61999 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Odf1Q61999 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Odf1Q61999 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Odf1Q61999 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Odf1Q61999 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Odf1Q61999 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Odf1Q61999 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Odf1Q61999 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Odf1Q61999 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Odf1Q61999 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Odf1Q61999 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Odf1Q61999 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Odf1Q61999 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Odf1Q61999 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Odf1Q61999 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Odf1Q61999 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Odf1Q61999 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Odf1Q61999 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Odf1Q61999 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Odf1Q61999 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Odf1Q61999 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Odf1Q61999 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Odf1Q61999 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Odf1Q61999 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Odf1Q61999 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Odf1Q61999 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Odf1Q61999 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Odf1Q61999 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Odf1Q61999 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Odf1Q61999 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Odf1Q61999 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Odf1Q61999 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Odf1Q61999 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Odf1Q61999 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Odf1Q61999 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Odf1Q61999 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Odf1Q61999 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Odf1Q61999 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Odf1Q61999 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Odf1Q61999 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Odf1Q61999 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Odf1Q61999 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Odf1Q61999 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Odf1Q61999 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Odf1Q61999 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Odf1Q61999 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Odf1Q61999 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Odf1Q61999 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Odf1Q61999 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Odf1Q61999 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Odf1Q61999 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Odf1Q61999 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Odf1Q61999 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Odf1Q61999 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Odf1Q61999 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Odf1Q61999 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Odf1Q61999 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Odf1Q61999 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Odf1Q61999 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Odf1Q61999 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Odf1Q61999 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Odf1Q61999 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Odf1Q61999 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Odf1Q61999 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Odf1Q61999 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Odf1Q61999 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Odf1Q61999 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Odf1Q61999 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Odf1Q61999 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Odf1Q61999 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Odf1Q61999 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Odf1Q61999 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Odf1Q61999 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Odf1Q61999 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Odf1Q61999 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Odf1Q61999 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Odf1Q61999 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Odf1Q61999 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Odf1Q61999 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Odf1Q61999 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Odf1Q61999 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Odf1Q61999 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Odf1Q61999 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Odf1Q61999 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Odf1Q61999 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Odf1Q61999 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Odf1Q61999 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Odf1Q61999 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Odf1Q61999 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Odf1Q61999 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Odf1Q61999 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Odf1Q61999 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms