Protein–RNA interactions for Protein: Q61805

Lbp, Lipopolysaccharide-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LbpQ61805 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LbpQ61805 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LbpQ61805 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LbpQ61805 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LbpQ61805 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LbpQ61805 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LbpQ61805 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LbpQ61805 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LbpQ61805 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LbpQ61805 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LbpQ61805 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LbpQ61805 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LbpQ61805 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LbpQ61805 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LbpQ61805 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LbpQ61805 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LbpQ61805 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LbpQ61805 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LbpQ61805 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LbpQ61805 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LbpQ61805 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LbpQ61805 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LbpQ61805 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LbpQ61805 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LbpQ61805 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LbpQ61805 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LbpQ61805 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LbpQ61805 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LbpQ61805 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
LbpQ61805 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
LbpQ61805 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LbpQ61805 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LbpQ61805 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LbpQ61805 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LbpQ61805 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LbpQ61805 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LbpQ61805 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LbpQ61805 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LbpQ61805 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
LbpQ61805 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LbpQ61805 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LbpQ61805 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LbpQ61805 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LbpQ61805 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LbpQ61805 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LbpQ61805 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LbpQ61805 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
LbpQ61805 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LbpQ61805 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LbpQ61805 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LbpQ61805 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LbpQ61805 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LbpQ61805 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LbpQ61805 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LbpQ61805 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LbpQ61805 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LbpQ61805 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LbpQ61805 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LbpQ61805 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LbpQ61805 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LbpQ61805 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LbpQ61805 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LbpQ61805 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LbpQ61805 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
LbpQ61805 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
LbpQ61805 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LbpQ61805 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LbpQ61805 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LbpQ61805 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LbpQ61805 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LbpQ61805 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LbpQ61805 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LbpQ61805 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LbpQ61805 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
LbpQ61805 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LbpQ61805 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LbpQ61805 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LbpQ61805 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LbpQ61805 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LbpQ61805 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LbpQ61805 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LbpQ61805 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LbpQ61805 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LbpQ61805 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LbpQ61805 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
LbpQ61805 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
LbpQ61805 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LbpQ61805 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LbpQ61805 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LbpQ61805 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
LbpQ61805 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
LbpQ61805 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
LbpQ61805 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LbpQ61805 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LbpQ61805 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LbpQ61805 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
LbpQ61805 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LbpQ61805 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
LbpQ61805 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
LbpQ61805 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms