Protein–RNA interactions for Protein: Q61687

Atrx, Transcriptional regulator ATRX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,476 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrxQ61687 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AtrxQ61687 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AtrxQ61687 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
AtrxQ61687 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AtrxQ61687 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AtrxQ61687 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AtrxQ61687 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AtrxQ61687 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AtrxQ61687 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
AtrxQ61687 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AtrxQ61687 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
AtrxQ61687 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
AtrxQ61687 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
AtrxQ61687 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
AtrxQ61687 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AtrxQ61687 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AtrxQ61687 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AtrxQ61687 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
AtrxQ61687 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AtrxQ61687 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
AtrxQ61687 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AtrxQ61687 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
AtrxQ61687 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
AtrxQ61687 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AtrxQ61687 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AtrxQ61687 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AtrxQ61687 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
AtrxQ61687 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AtrxQ61687 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
AtrxQ61687 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
AtrxQ61687 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AtrxQ61687 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AtrxQ61687 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AtrxQ61687 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AtrxQ61687 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AtrxQ61687 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AtrxQ61687 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AtrxQ61687 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
AtrxQ61687 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
AtrxQ61687 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
AtrxQ61687 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
AtrxQ61687 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
AtrxQ61687 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
AtrxQ61687 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AtrxQ61687 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AtrxQ61687 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AtrxQ61687 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AtrxQ61687 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AtrxQ61687 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AtrxQ61687 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AtrxQ61687 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AtrxQ61687 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AtrxQ61687 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AtrxQ61687 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AtrxQ61687 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AtrxQ61687 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AtrxQ61687 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AtrxQ61687 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AtrxQ61687 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AtrxQ61687 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AtrxQ61687 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AtrxQ61687 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AtrxQ61687 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
AtrxQ61687 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
AtrxQ61687 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
AtrxQ61687 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AtrxQ61687 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
AtrxQ61687 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
AtrxQ61687 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AtrxQ61687 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AtrxQ61687 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AtrxQ61687 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AtrxQ61687 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
AtrxQ61687 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AtrxQ61687 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AtrxQ61687 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
AtrxQ61687 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AtrxQ61687 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AtrxQ61687 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AtrxQ61687 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AtrxQ61687 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
AtrxQ61687 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AtrxQ61687 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
AtrxQ61687 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
AtrxQ61687 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AtrxQ61687 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AtrxQ61687 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AtrxQ61687 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AtrxQ61687 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AtrxQ61687 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AtrxQ61687 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AtrxQ61687 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AtrxQ61687 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AtrxQ61687 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
AtrxQ61687 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AtrxQ61687 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AtrxQ61687 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AtrxQ61687 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AtrxQ61687 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
AtrxQ61687 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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